Connaissez-vous ces petits amis qui vivent dans vos intestins ? (Le microbiome intestinal) Parlons-en !

Seriez-vous surpris d'apprendre que des millions de minuscules organismes vivent en nous, notamment dans nos intestins ? C'est ce qu'on appelle le microbiote intestinal . À l'instar d'une grande forêt qui abrite une grande variété d'arbres et d'animaux, notre intestin est un écosystème foisonnant de micro-organismes. Il est unique à chaque individu, comme une empreinte digitale.

Qu'est-ce que le microbiome intestinal ? Essayons de le comprendre très simplement.

En termes simples, un biome est un écosystème unique, adapté à un environnement particulier et aux organismes qui y vivent. Ainsi, votre intestin, c'est-à-dire le gros intestin et l'intestin grêle qu'il contient, forment également un petit écosystème. Il abrite des milliards de micro-organismes invisibles à l'œil nu, parmi lesquels des milliers d'espèces de bactéries , ainsi que des virus , des champignons et des parasites .

Réfléchissez-y : votre microbiote intestinal est unique. Un bébé reçoit d’abord ces microbes de sa mère, soit lors de l’accouchement par voie basse, soit par l’allaitement. Ensuite, de nouveaux microbes viennent enrichir notre écosystème grâce à notre alimentation et à notre environnement. Cependant, certains facteurs peuvent nuire à ces micro-organismes et réduire leur population.

Pourquoi ces minuscules organismes présents dans l'intestin (le microbiome intestinal) sont-ils si importants pour nous ?

La plupart des microbes présents dans notre intestin vivent en symbiose avec nous. En médecine, on parle de relation symbiotique . Cela signifie que nous en tirons tous deux profit : nous leur fournissons nourriture et abri, et en retour, ils rendent de nombreux services essentiels à notre organisme. De plus, ces précieux alliés contribuent à limiter la prolifération des micro-organismes pathogènes.

Imaginez votre microbiote intestinal comme un magnifique verger luxuriant que vous avez planté. Il vous fournit des aliments nutritifs et des remèdes. Quand le verger est sain et florissant, c'est bon pour vous. Mais si le sol s'appauvrit, s'il devient toxique, ou si les mauvaises herbes et les parasites envahissent les bonnes plantes, tout l'écosystème se dérègle, n'est-ce pas ? C'est exactement ça.

Que font réellement ces amis de notre intestin (le microbiome intestinal) ?

Cet ensemble de microbes présents dans votre intestin, appelé microbiote intestinal , est connecté à de nombreux systèmes de votre organisme et contribue à diverses fonctions. Certains médecins le considèrent même comme un organe à part entière. Nous sommes encore en train d'étudier certaines de ces connexions, mais d'autres sont déjà bien connues.

Comment aider le système digestif

Certaines bactéries de notre intestin nous aident à décomposer les glucides complexes et les fibres que nous ne pouvons pas digérer seuls. Ce faisant, elles produisent des nutriments essentiels comme les acides gras à chaîne courte (AGCC) . Elles fournissent également les enzymes nécessaires à la synthèse de certaines vitamines, telles que les vitamines B1, B9, B12 et K.

Bien que ces nutriments puissent paraître mineurs, leurs carences en micronutriments peuvent avoir un impact important sur notre santé. En particulier, les acides gras à chaîne courte (AGCC) nourrissent les cellules de la paroi intestinale et contribuent au maintien d'un microbiote intestinal sain.

De plus, ces bactéries participent au métabolisme de la bile dans l'intestin. Notre foie envoie la bile à l'intestin grêle pour faciliter la digestion des graisses. Une fois cette fonction remplie, les bactéries et leurs enzymes décomposent la bile, et les acides biliaires sont réabsorbés par le foie et recyclés. C'est ce qu'on appelle le cycle entérohépatique . Imaginez si ce processus s'arrêtait : notre corps ne pourrait plus recycler les acides biliaires et le foie n'aurait pas assez d'acides pour produire de la nouvelle bile. Notre système digestif n'aurait alors plus assez de bile pour digérer et absorber les graisses. De plus, le cholestérol contenu dans la bile commencerait à s'accumuler dans notre sang.

Comment renforcer notre système immunitaire

Les microbes bénéfiques de notre intestin apprennent à notre système immunitaire à les distinguer des organismes pathogènes. Saviez-vous que notre intestin est le plus grand organe de notre système immunitaire ? Il contient environ 80 % de nos cellules immunitaires. Ces cellules contribuent à éliminer les agents pathogènes qui pénètrent quotidiennement dans notre organisme.

Les bonnes bactéries intestinales entrent en compétition directe avec les mauvaises pour l'espace et les nutriments, limitant ainsi la prolifération de ces dernières. Certaines infections bactériennes chroniques affectant notre système gastro-intestinal, comme Clostridium difficile et Helicobacter pylori, sont directement liées à une diminution de la population de ces bonnes bactéries.

Les acides gras à chaîne courte (AGCC) , produits par les bactéries intestinales bénéfiques, présentent de nombreux avantages pour notre système immunitaire. Ils contribuent au maintien de la barrière intestinale , empêchant ainsi les bactéries et leurs toxines de passer dans le sang. Ils possèdent également des propriétés anti-inflammatoires qui réduisent l'inflammation intestinale.

L'inflammation est une fonction de notre système immunitaire, mais elle peut parfois devenir excessive. L'inflammation chronique est une caractéristique des maladies auto-immunes . Elle pourrait également être liée à de nombreuses autres maladies, dont le cancer. Il semblerait que les acides gras à chaîne courte atténuent cette réponse inflammatoire.

La connexion avec le cerveau (axe intestin-cerveau)

Les microbes intestinaux peuvent influencer notre système nerveux via l'axe intestin-cerveau . Il s'agit d'un réseau de nerfs, de neurones et de neurotransmetteurs qui parcourt notre tube digestif. Étonnamment, certaines bactéries produisent ou stimulent la production de neurotransmetteurs comme la sérotonine . Ce sont ces substances chimiques qui transmettent des signaux à notre cerveau.

Les produits bactériens peuvent également affecter notre système nerveux. Les acides gras à chaîne courte semblent avoir un effet bénéfique, mais les toxines bactériennes peuvent endommager les nerfs. Les chercheurs étudient encore le rôle de notre microbiote intestinal dans diverses maladies neurologiques, troubles du comportement, douleurs nerveuses et problèmes psychologiques.

Aide pour le système endocrinien

Les microbes intestinaux et leurs produits interagissent également avec les cellules endocrines de la paroi intestinale. Ces cellules ( entéroendocrines ) font de l'intestin le plus grand organe endocrinien du corps. Elles sécrètent des hormones qui régulent divers aspects du métabolisme, comme la glycémie, la faim et la satiété.

Les chercheurs poursuivent leurs investigations sur le lien entre notre microbiote intestinal et des affections telles que le syndrome métabolique (qui comprend l'obésité, la résistance à l'insuline et le diabète de type 2 ) et la stéatose hépatique. On pense que ces affections sont liées à certains microbes intestinaux, mais lesquels précisément restent encore à déterminer.

Où se situe réellement le microbiome intestinal ?

On appelle généralement notre tube digestif « l'intestin ». La plupart des gens pensent aux intestins. Bien que l'estomac et l'intestin grêle contiennent quelques microbes intestinaux, la majorité d'entre eux vivent dans le gros intestin, ou côlon . Ils se déplacent librement à l'intérieur de celui-ci ou sont fixés à la muqueuse qui tapisse ses parois internes.

Les types de bactéries qui vivent dans le gros intestin sont différents de celles qui vivent ailleurs. Il s'agit principalement de bactéries anaérobies , c'est-à-dire qu'elles ont besoin d'un environnement pauvre en oxygène pour survivre. Elles ne peuvent pas se développer dans la partie supérieure du tube digestif en raison de la forte concentration d'oxygène, de la vitesse du transit et de la présence de sucs digestifs agressifs.

Ces bactéries anaérobies intestinales accomplissent des fonctions essentielles dans notre gros intestin, fonctions qu'elles seules peuvent assurer. Ce sont elles qui décomposent les fibres indigestes de notre système digestif et produisent des nutriments indispensables à notre organisme. De plus, ces organismes ne nous sont bénéfiques que dans leur écosystème naturel.

Important : Si ces bactéries quittent le côlon, elles peuvent devenir nocives. Si elles migrent vers l’intestin grêle et s’y installent, elles peuvent perturber la digestion. De plus, si elles envahissent la paroi intestinale ou si elles s’échappent par une plaie, elles peuvent provoquer des infections.

Qu'est-ce que la dysbiose ? Est-ce un déséquilibre de la flore intestinale ?

Les médecins utilisent le terme dysbiose pour décrire un microbiome intestinal déséquilibré ou malsain.

La dysbiose est :

• Perte ou diminution des bactéries bénéfiques.
• Prolifération excessive de bactéries nocives, potentiellement pathogènes.
• Perte de la diversité globale des micro-organismes.

La dysbiose peut débuter par l'un de ces trois facteurs, mais les autres surviennent rapidement. La diminution des bactéries bénéfiques rend notre intestin plus vulnérable aux agents pathogènes et aux organismes invasifs. Ces derniers peuvent proliférer au détriment des autres micro-organismes, réduisant ainsi la diversité de l'écosystème intestinal.

Quels sont les facteurs qui affectent ces petits amis de notre intestin ?

Tout comme un jardin est influencé par les nutriments, les toxines, les parasites et les mauvaises herbes, les microbes de notre intestin le sont également. Autrement dit, notre alimentation, notre exposition aux produits chimiques, aux agents pathogènes et le transit intestinal régulier ont un impact sur eux.

L'alimentation (régime alimentaire)

Les différentes bactéries présentes dans notre intestin ont besoin de différents types de fibres pour se développer. Chaque organisme privilégie différents aliments complets. En réponse, il produit des acides gras à chaîne courte (AGCC) et d'autres métabolites. Ces substances nourrissent notre intestin et abaissent son pH, créant ainsi un environnement plus favorable au développement des bactéries bénéfiques.

En revanche, une alimentation riche en sucre et en graisses saturées favorise le développement de micro-organismes moins bénéfiques. Les aliments transformés sont non seulement pauvres en fibres et en micronutriments (vitamines et minéraux), mais ils contiennent également de nombreux conservateurs et additifs. Ces derniers peuvent être nocifs pour notre microbiote.

Produits chimiques

Parmi les substances chimiques toxiques pour notre microbiote intestinal figurent l'alcool, la fumée de tabac et les polluants environnementaux. De plus, certains médicaments, comme les antibiotiques , peuvent détruire aussi bien les bonnes que les mauvaises bactéries. D'autres médicaments, tels que les inhibiteurs de l'acidité gastrique , peuvent affecter le microbiote en modifiant le pH intestinal.

En cas d'exposition chimique temporaire, par exemple lors de la prise d'un médicament sur une courte durée pour soigner une maladie, notre microbiote intestinal retrouve généralement son équilibre. Cependant, une exposition prolongée peut en modifier la composition. La prise régulière de certains médicaments ou une consommation fréquente d'alcool peuvent perturber la croissance de certaines bactéries.

Diversité

Dans un microbiote intestinal sain, différents types de microbes s'entraident. Imaginez comment différentes plantes dans un jardin se pollinisent mutuellement et enrichissent le sol. Par exemple, certains types décomposent des composés pour nourrir d'autres types, ou leurs déchets modifient l'acidité du sol.

En revanche, un écosystème qui ne favorise pas une biodiversité microbienne saine est plus susceptible d'être envahi par des espèces invasives. En l'absence d'une saine compétition, ces « mauvaises herbes » et « ravageurs » colonisent l'habitat, privant les autres espèces des ressources nécessaires à leur survie.

Motilité intestinale

La motilité intestinale désigne le mouvement systématique de vos intestins. C'est ainsi que votre microbiote se renouvelle. En traversant votre gros intestin, les bactéries contribuent à décomposer les composés indigestes en nutriments assimilables. La plupart de ces nutriments sont ensuite éliminés dans vos selles. La durée de ce processus influence votre microbiote.

Au fil du transit des aliments et des déchets dans le système digestif, différents micro-organismes se répartissent à différents endroits. Si ce trajet est trop rapide, ils n'ont pas le temps de s'installer et d'accomplir leur rôle. En revanche, s'il est trop lent, ils peuvent proliférer excessivement et se multiplier de façon anarchique.

Quels problèmes de santé surviennent lorsque cet équilibre intestinal (microbiote intestinal) est perturbé ?

Il existe des maladies directement liées à la dysbiose intestinale, c'est-à-dire à la perte de cet équilibre.

affections médicales directement liées

• Infections : Les agents pathogènes invasifs peuvent provoquer des infections intestinales temporaires ou chroniques. Celles-ci peuvent entraîner diarrhée, inflammation ( colite ) et lésions toxiques de la paroi intestinale. Certaines souches peuvent envahir directement la barrière intestinale, pénétrer dans la circulation sanguine et menacer de se propager dans tout l’organisme. La dysbiose affaiblit les défenses de l’intestin contre ces agents pathogènes.
• SIBO (prolifération bactérienne de l'intestin grêle) : il s'agit d'une dysbiose intestinale. Cela signifie que certaines bactéries prolifèrent de façon excessive, consomment trop de ressources et produisent trop de déchets. Parfois, des bactéries du gros intestin peuvent migrer vers l'intestin grêle et s'y installer. Un transit intestinal ralenti peut en être la cause.
• MII (maladie inflammatoire de l'intestin) :Il s'agit d'un groupe de maladies auto-immunes qui affectent les intestins. La rectocolite hémorragique , la colite microscopique et la maladie de Crohn en font partie. La dysbiose intestinale est l'un des critères utilisés pour diagnostiquer les MICI (maladies inflammatoires chroniques de l'intestin). Les chercheurs ignorent encore précisément laquelle de ces deux affections survient en premier, mais ils savent qu'elles sont liées et que l'une contribue à l'aggravation de l'autre.
• Athérosclérose : Certaines bactéries intestinales, moins bénéfiques, augmentent le risque de maladies cardiovasculaires en produisant un sous-produit appelé oxyde de triméthylamine (TMAO) . Ce sous-produit s’accumule dans les artères et contribue à l’athérosclérose , c’est-à-dire à l’épaississement de la paroi artérielle. C’est l’un des éléments recherchés lors des analyses sanguines cardiaques pour évaluer le risque de maladie coronarienne .

D'autres situations peuvent être indirectement liées

Voici d'autres affections qui peuvent être indirectement liées à la dysbiose :

• Allergies
• Anxiété
• Asthme
• Autisme
• Syndrome de fatigue chronique (SFC)
• cancer du côlon
• Diabète
• Dépression
• Stéatose hépatique
• Syndrome du côlon irritable (SCI)
• Cancer du foie
• Sclérose en plaques (SEP)
• maladies neurodégénératives
• Obésité
• Cancer du pancréas
• Arthrite rhumatoïde (PR)

Quels sont les signes d'un problème au niveau de mon microbiome intestinal ?

Les symptômes courants de la dysbiose intestinale comprennent :

• Gaz et douleurs dues aux gaz
• Estomac gonflé
• mauvaise digestion
• Douleurs dans le bas-ventre
• Diarrhée
• Constipation

Peut-on tester la santé de cet intestin (microbiote intestinal) ?

De nombreux laboratoires privés proposent des kits d'analyse du microbiote intestinal . Il suffit d'envoyer un échantillon de selles au laboratoire pour recevoir un rapport décrivant brièvement la composition de votre microbiote intestinal. Cependant, les médecins n'utilisent ni ne recommandent généralement ces tests.

C’est parce que nous ne connaissons pas encore suffisamment les différents types de microbes intestinaux et leur impact sur notre santé pour qu’un rapport comme celui-ci soit utile. De nombreuses recherches passionnantes sont en cours, mais…Il reste encore beaucoup de chemin à parcourir avant qu'un test du microbiome intestinal puisse vous fournir des conseils de santé pratiques et personnalisés.

Comment les médecins traitent-ils cela ?

Voici quelques traitements médicaux pour les problèmes liés à votre microbiote intestinal :

• Régime d'élimination : Il s'agit d'un régime de courte durée. Il vise à identifier les aliments responsables de vos symptômes gastro-intestinaux. Ce sont souvent des aliments dont raffolent votre microbiote intestinal. Lorsque ce dernier en consomme une trop grande quantité, il produit un excès de déchets, provoquant ainsi des symptômes comme les ballonnements et la diarrhée. Une solution pour les atténuer est de les supprimer de son alimentation.
• Antibiotiques : En cas d’infection ou de prolifération excessive de certaines bactéries intestinales, le traitement habituel consiste en une cure d’antibiotiques. Une fois celle-ci terminée, un microbiote intestinal sain peut être rétabli. Cependant, chez certaines personnes, un coup de pouce est nécessaire pour retrouver cet équilibre. Les médecins peuvent alors recommander la prise de compléments alimentaires comme les prébiotiques et les probiotiques .
• Transplantation fécale : La transplantation fécale est un traitement capable de restaurer un microbiote intestinal gravement endommagé. Elle consiste à transférer un échantillon de microbes d’un intestin sain vers un intestin malade. Actuellement, elle est approuvée uniquement pour le traitement des infections récurrentes à Clostridium difficile résistantes aux antibiotiques. Cependant, les chercheurs étudient la possibilité de l’utiliser pour traiter d’autres affections.

Alors, comment prendre soin de ces petits amis de notre intestin (le microbiote intestinal) ? (Points à retenir)

Une alimentation et un mode de vie sains peuvent contribuer à un microbiote intestinal sain. Par exemple :

• Améliorez naturellement votre santé intestinale en adoptant une alimentation variée et principalement végétale. Privilégiez les aliments complets et variés, comme les céréales complètes, les légumes et les fruits. Ils apportent à votre microbiote intestinal une quantité importante de fibres et de micronutriments. Ces aliments contribuent également à réduire l'inflammation intestinale, ce qui a un impact positif sur l'environnement interne. À l'inverse, les aliments transformés et la restauration rapide produisent l'effet inverse.
• Essayez les probiotiques et les prébiotiques. Vous pouvez vous en procurer sous forme de compléments alimentaires ou par l'alimentation. Les probiotiques sont des micro-organismes bénéfiques que vous pouvez consommer. Ils peuvent être pris sous forme de compléments alimentaires ou d'aliments fermentés et favoriser ainsi la colonisation de votre côlon. Votre médecin peut vous aider à choisir le probiotique le plus adapté à vos besoins. Les prébiotiques sont des fibres alimentaires qui nourrissent les bonnes bactéries intestinales.
• Soyez prudent avec les antibiotiques. Il y a des moments où leur prise est indispensable, mais d'autres où elle est inutile. La surconsommation d'antibiotiques au sein de la population générale entraîne une résistance aux antibiotiques . Chez l'humain, cela peut détruire la flore intestinale, en plus des bactéries pathogènes. Parfois, cela peut perturber l'équilibre du microbiote intestinal et favoriser la prolifération de bactéries indésirables.

Le microbiote intestinal est un sujet brûlant dans le milieu médical et du bien-être ces derniers temps, et on comprend aisément pourquoi. Ces minuscules organismes semblent disséminés dans tout le corps ; il est donc possible qu’ils détiennent la clé de la compréhension et du traitement de certaines des maladies les plus complexes.

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À mesure que la recherche progresse, les médecins restent à la fois optimistes et prudents. Plus nous en apprenons, plus nous prenons conscience de l'étendue de ce qui nous reste à découvrir. Mais nos découvertes confirment aussi certains de nos principes de bien-être les plus anciens. Notamment : une alimentation saine et composée d'aliments complets est essentielle à la santé intestinale. Alors, n'oubliez pas de prendre soin de ces petits amis qui peuplent votre intestin et adoptez de bonnes habitudes de vie !

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