Opitaanpa PCR-testistä yksinkertaisesti, aivan kuin ystävältä!

Saatat muistaa, että Covid-19-pandemian aikana puhuimme kaikki PCR-testistä . Jotkut ihmiset ovat varmasti olleet hieman peloissaan ajatellessaan nenään työnnettyä tikkua. Mutta mikä tämä PCR-testi oikeastaan ​​on? Voiko se havaita vain Covid-19:n? Ei, PCR on erittäin tärkeä lääketieteellinen testimenetelmä, joka auttaa monissa asioissa. Puhutaanpa tästä kaikesta tänään yksinkertaisesti ja selkeästi, aivan kuin puhuisimme hyvän ystävän kanssa.

Mikä on PCR? Voitko selittää sitä hieman?

Yksinkertaisesti sanottuna PCR on lyhenne sanoista Polymerase Chain Reaction (polymeraasiketjureaktio). Sitä käytetään geneettisen materiaalin , joko DNA:n tai RNA:n , havaitsemiseen kehossamme. Kuvittele pieni näyte, joka otetaan sinusta, se voi olla veripisara tai näyte nenäsi sisältä. Tuo pieni DNA:n tai RNA:n pala näytteessä otetaan ja laboratoriossa tehdään miljoonia, ehkä miljardeja, kopioita. Tätä tiedemiehet kutsuvat amplifikaatioksi , joka tarkoittaa "lisäämistä" tai "moninkertaistamista". Se on kuin tekisi useita kopioita yhdestä paperiarkista kopiokoneella.

Tekemällä useita kopioita näin tutkijoiden on helpompi tutkia alkuperäisen pienen näytteen DNA:ta tai RNA:ta ja selvittää, onko siinä jotain erityistä. PCR kuuluu testiryhmään nimeltä nukleiinihappojen monistustestit (NAAT) .

Vaikka monet ihmiset ovat kuulleet sanan PCR Covid-19-testauksen yhteydessä, tätä teknologiaa on käytetty lääketieteen alalla jo pitkään, ja se on erittäin hyödyllinen menetelmä.

Mitä PCR:llä voidaan havaita?

Katsotaanpa nyt, mitä asioita tämä PCR-testi voi havaita. Monet ihmiset luulevat, että se on tarkoitettu vain Covid-19:lle. Mutta näin ei ole. Katsokaa tätä:

• Tartuntataudit: PCR-testi voi auttaa selvittämään, onko kuumeesi, vilustumisesi tai yskäsi aiheuttanut virus , bakteeri , sieni vai loinen . Esimerkiksi:
• SARS-CoV-2- virus, joka aiheuttaa COVID-19-taudin (COVID-19) .
• Influenssa , niin me yleisesti kutsumme flunssaksi.
• Respiratory syncytial virus (RSV), joka on erityisen yleinen pikkulapsilla.
• Tuberkuloosia aiheuttava bakteeri.
• Monet muut virus- ja bakteeri-infektiot.
• Geneettiset sairaudet: Joillakin ihmisillä on perinnöllisiä geneettisiä sairauksia, eikö niin? Tällaisia ​​sairauksia on esimerkiksi kystinen fibroosi.Tätä PCR-testiä käytetään myös sellaisten sairauksien diagnosointiin kuin Huntingtonin tauti ja fragiili X -oireyhtymä . Nämä ovat hyvin monimutkaisia ​​sairauksia, joten varhainen havaitseminen on erittäin tärkeää hoidon kannalta.
• Syöpätyypit: Tämä menetelmä auttaa myös tunnistamaan tiettyjä syöpätyyppejä, kuten lymfoomaa .
• Geenimuutokset syövässä: Syöpää sairastavaa henkilöä hoidettaessa tämä PCR-testi voi myös havaita tiettyjä geenivariaatioita/mutaatioita kyseisissä syöpäsoluissa. Tämä mahdollistaa kohdennetun hoidon käytön näiden tiettyjen muutosten kohdistamiseksi. Tämä on merkittävä edistysaskel syövän hoidon alalla.
• Tulevaisuuden sairastumisriski: Ihmisillä, joilla on tiettyjä geneettisiä muutoksia, voi olla suurempi riski sairastua vakaviin sairauksiin, kuten syöpään, tulevaisuudessa. Tätä PCR-testiä käytetään myös syöpäriskin geneettiseen testaukseen . Näin voit olla tietoinen etukäteen ja tehdä tarvittaessa elämäntapamuutoksia tai pysyä valppaana käymällä säännöllisesti testeissä.
• Prenataalinen testaus: PCR on myös hyödyllinen testeissä, joilla selvitetään, onko raskaana olevan naisen syntymättömällä lapsella geneettinen sairaus.

Eikä siinä kaikki, olet ehkä nähnyt sen elokuvissa, joissa DNA-todisteita, kuten rikospaikalta löydettyä pientä hiusta tai veritahraa, otetaan ja käytetään rikollisen tunnistamiseen. Myös oikeuslaboratoriot käyttävät tätä PCR-tekniikkaa DNA:n määrän lisäämiseen ja testien suorittamiseen.

Mitä testejä ja menetelmiä PCR-tekniikkaa käytetään?

PCR-tekniikkaa käytetään useissa eri testausmenetelmissä. Tarvittavan näytteen tyyppi riippuu siitä, mitä testataan. Tässä on joitakin esimerkkejä:

• Verikokeet: Verinäyte otetaan ja PCR:ää käytetään geneettisten muutosten ja tiettyjen tartuntatautien havaitsemiseen.
• Nenänielun limanäyte: Nenän tai kurkun sisältä otettua limanäytettä voidaan käyttää hengitystieinfektioiden, kuten influenssan, COVID-19:n ja RSV:n, testaamiseen. Tätä olemme kaikki kokeneet COVID-aikana.
• Preimplantaatiogeneettinen diagnoosi (PGD) tai preimplantaatiogeneettinen seulonta (PGS): Koeputkihedelmöityksen (IVF) aikana alkioista otetaan muutamia soluja ja testataan geneettisten sairauksien varalta ennen kuin ne istutetaan äidin kohtuun. Tämä tehdään yleensä muutaman päivän kuluttua munasolujen keräämisestä.
• Lapsivesipunktio:Raskauden aikana äidin kohdussa vauvan ympärillä olevasta pienestä määrästä lapsivettä voidaan testata vauvan geneettistä tilaa PCR-testillä. Tämän testin suorittaa erikoislääkäri.
• Biopsia: Syöpäsolujen geneettisten mutaatioiden tunnistamiseksi (molekyylitestaus) otetaan pieni näyte kasvaimesta (kasvainbiopsia) tai luuydinbiopsia. Tämä on kuin pieni leikkaus. Näytettä käytetään sitten PCR:ään geneettisten muutosten etsimiseksi.

Miten tähän kokeeseen valmistaudutaan?

Useimmissa tapauksissa PCR-testi ei vaadi erityistä valmistelua. Se riippuu kuitenkin siitä, mitä testataan ja mitä menetelmää näytteen keräämiseen käytetään. Esimerkiksi jotkut verikokeet saattavat vaatia muutaman tunnin paastoa. Siksi on parasta kysyä lääkäriltäsi tai testauspaikalta, onko sinun tehtävä jotain erityistä.

Miten PCR toimii? Hieman tiedettä!

Tämä on hieman tieteellinen tarina, mutta selitän sen yksinkertaisesti. PCR:n avulla tunnistetaan sekvenssi, joka on ainutlaatuinen etsimällesi DNA:lle eli sille spesifinen. Tämä sekvenssi voi olla tietty geneettinen muutos syövässä tai se voi olla viruksen tai bakteerin geneettinen koodi. Tätä kutsutaan kohde-DNA:ksi .

Nimi "polymeraasiketjureaktio" viittaa prosessiin, jossa laboratoriossa valmistetaan (amplifioidaan) suuri määrä kopioita kohde-DNA:sta. Tässä prosessissa käytetään DNA-polymeraasiksi kutsuttua entsyymiä. Tämä entsyymi tekee kopioita kohde-DNA:sta, jos sitä on näytteessä.

Tämä "ketjureaktio" tapahtuu, kun liuos käy läpi useita lämmitys- ja jäähdytyssyklejä. Yhdessä syklissä DNA:n määrä voi kaksinkertaistua. Ajattele sitä yhden ja kahden, kahden ja neljän, neljän ja kahdeksan yhdistelmänä... ja niin edelleen, jolloin lopulta syntyy miljoonia kopioita. Tämän etuna on, että PCR voi havaita jopa pieniä määriä DNA:ta tai RNA:ta, jotka muuten jäisivät huomaamatta muissa testeissä.

Usein PCR:n jälkeen tutkijoiden on tehtävä lisää testejä monistetun DNA:n analysoimiseksi. Mutta joskus liuokseen lisätään PCR-prosessin aikana erityisiä leimoja, jotka voivat kertoa, onko näyte positiivinen vai negatiivinen. Tätä menetelmää voidaan käyttää tulosten nopeaan saamiseen, erityisesti etsittäessä infektioita, kuten viruksia.

Millaisia ​​PCR-tyyppejä on olemassa?

PCR-menetelmiä on erityyppisiä. Jotkut vaativat lisävaiheita DNA:n kopioimiseksi tai analysoimiseksi. Tarkastellaan kahta päätyyppiä:

1. Käänteiskopioijaentsyymin PCR (RT-PCR)

Kuvittele, että kopioitava ja etsimämme geneettinen informaatio ei ole DNA:ssa, vaan RNA:ssa. (Esimerkiksi Covid-19-viruksella on RNA:ta). Tässä RT-PCR :ssä RNA (RNA) muunnetaan ensin DNA:ksi erityisellä entsyymillä (käänteiskopioijaentsyymillä). Muodostunutta DNA:ta kutsutaan komplementaariseksi DNA:ksi (cDNA) . Sen jälkeen suoritetaan aiemmin mainittu normaali PCR-prosessi. Normaali PCR voidaan nimittäin tehdä vain DNA:lle.

2. Reaaliaikainen PCR / kvantitatiivinen PCR (Q-PCR)

Tässä tapauksessa DNA-kopioiden muodostuessa niihin lisätään erityisiä fluoresoivia leimoja . Nämä leimat lähettävät valoa sitoutuessaan kohde-DNA:han. Sitten, ilman lisätestejä, testin tekijät voivat nähdä reaaliajassa, onko kyseistä DNA:ta näytteessä. Sen lisäksi he voivat saada kvantitatiivisen käsityksen siitä, kuinka paljon sitä on läsnä.

Hämmentävää on, että jotkut kutsuvat tätä myös "RT-PCR:ksi". Se ei kuitenkaan ole sama kuin aiemmin mainittu käänteiskopioijaentsyymin PCR. Tätä reaaliaikaista PCR-menetelmää voidaan myös käyttää yhdessä aiemmin mainitun käänteiskopioijaentsyymin PCR:n kanssa. Silloin sitä kutsutaan reaaliaikaiseksi RT-PCR:ksi (real-time RT-PCR) . Tätä reaaliaikaista RT-PCR-menetelmää käytetään nenänäytteen testeissä RNA-virusten, kuten Covid-19:n ja influenssan, havaitsemiseksi.

Mitä PCR-testin tulokset kertovat meille?

Kun saat PCR-testin tulokset, sanamuoto voi olla hieman erilainen riippuen siitä, mitä sinulta testattiin.

• Yleensä, jos tuloksessa lukee "havaittu" tai "läsnä", se tarkoittaa, että sinulla on testin etsimä geneettinen mutaatio tai infektio.
• Jos tuloksessa lukee "ei havaittu", se tarkoittaa, että testi ei löytänyt testattavaa kohde-DNA:ta tai -RNA:ta. Infektion tapauksessa tämä voi kuitenkin joskus tarkoittaa, että testi tehtiin liian aikaisin infektioprosessin vaiheessa. Sinulla voi olla edelleen infektio, mutta virusta tai bakteereja ei välttämättä ole vielä riittävästi PCR:n havaitsemiseksi.

Miten tulkita Covid-19 PCR -tuloksia?

Tämä on asia, jonka monet ihmiset nyt tuntevat.

• Positiivinen COVID PCR -tulos – eli raportissasi lukee "Havaittu” – tarkoittaa, että olet todennäköisesti saanut COVID-19-tartunnan tai olet äskettäin toipunut COVID-19:stä (joskus PCR voi pysyä positiivisena jonkin aikaa toipumisen jälkeen).
• Jos saat negatiivisen ("Ei havaittu") COVID PCR -tuloksen, se tarkoittaa todennäköisesti, että sinulla ei ollut COVID-19-tartuntaa nenänäytteen ottohetkellä. Kuten aiemmin mainitsin, joskus infektion alkuvaiheessa, varsinkin jos olet oireeton, PCR-testit voivat olla negatiivisia. Joten jos sinulla on oireita, lääkärisi saattaa neuvoa sinua testautumaan uudelleen muutaman päivän kuluttua.

Kuinka kauan PCR-tulosten saaminen kestää?

Tämä vaihtelee myös suoritettavan testin mukaan.

• Nenäpuikkotestien tulokset yleisille viruksille, kuten influenssalle ja COVID-19:lle, saadaan yleensä muutaman tunnin tai päivän kuluttua.
• Verikokeita ja biopsiamenetelmiä käyttävien geenitestien tulosten saaminen voi kestää viikon tai kauemmin, koska analyysiprosessi on hieman monimutkaisempi.

Milloin sinun on mentävä lääkäriin?

Jos sinulla on kysyttävää tai huolenaiheita PCR-testistä tai sen tuloksista, muista keskustella lääkärisi kanssa. Hän voi selittää sinulle kaiken.

Tärkein kotiin vietävä viesti

Vaikka sana "PCR-testi" nousi yhtäkkiä jokapäiväiseen keskusteluumme vuoden 2020 COVID-19-pandemian myötä, se on itse asiassa erittäin arvokas teknologia, jota lääkärit ovat käyttäneet vuosikymmeniä. PCR auttaa tunnistamaan ja kopioimaan pieniä määriä DNA:ta tai RNA:ta, joita voidaan käyttää erilaisten terveysongelmien diagnosointiin.

Vaikka tämä on yleistä lääkäreille, se ei välttämättä ole yleistä sinulle. Ymmärrämme sen. Mutta parasta on, että se vaatii vain pienen näytteen kehostasi, ja toimenpide kestää yleensä vain muutaman minuutin. Jos sinulla on kysyttävää, huolenaiheita tai epäilyksiä tästä, keskustele lääkärisi kanssa. He selittävät sinulle kaiken. Pysy terveenä!

PCR -testi, DNA, RNA, geenitestaus, diagnoosi, Covid-19, virus