Hajde da saznamo o PCR testu jednostavno, baš kao od prijatelja!

Možda se sjećate da smo tokom pandemije Covid-19 svi pričali o PCR testu . Neki ljudi su vjerovatno bili malo uplašeni, razmišljajući o štapiću umetnutom u nos. Ali šta je tačno ovaj PCR test? Može li on otkriti samo Covid-19? Ne, PCR je vrlo važna metoda testiranja u medicini koja pomaže kod mnogo stvari. Hajde da danas razgovaramo o svemu ovome, jednostavno i jasno, kao da razgovaramo sa dobrim prijateljem.

Šta je PCR? Možete li to malo objasniti?

Jednostavno rečeno, PCR je skraćenica za lančanu reakciju polimeraze (Plymerase Chain Reaction ). Koristi se za detekciju genetskog materijala u našem tijelu, bilo DNK ili RNK . Zamislite mali uzorak uzet od vas, to može biti kap krvi ili bris iz unutrašnjosti vašeg nosa. Taj sićušni komadić DNK ili RNK u tom uzorku se uzima i milioni, možda milijarde, kopija se prave u laboratoriji. To je ono što naučnici nazivaju amplifikacijom , što znači "povećanje" ili "umnožavanje". To je kao da pravite mnogo kopija jednog lista papira fotokopir aparatom.

Pravljenjem mnogo ovakvih kopija, naučnicima je lakše proučavati DNK ili RNK u originalnom malom uzorku i vidjeti da li u njemu postoji nešto posebno. PCR pripada grupi testova koji se nazivaju testovi amplifikacije nukleinskih kiselina (NAAT) .

Iako su mnogi ljudi čuli riječ PCR u vezi s testiranjem na Covid-19, ova tehnologija se već dugo koristi u medicinskoj oblasti i vrlo je korisna metoda.

Šta se može otkriti PCR-om?

Sada da vidimo šta sve ovaj PCR test može otkriti. Mnogi ljudi misle da je samo za Covid-19. Ali to nije slučaj. Pogledajte:

• Zarazne bolesti: PCR može pomoći u utvrđivanju da li je groznica, prehlada ili kašalj uzrokovan virusom , bakterijom , gljivicom ili parazitom . Na primjer:
• Virus SARS-CoV-2 koji uzrokuje COVID-19 (COVID-19) .
• Gripa , tako obično nazivamo gripu.
• Respiratorni sincicijski virus (RSV), koji je posebno čest kod malih beba.
• Bakterije koje uzrokuju tuberkulozu.
• Mnoge druge virusne i bakterijske infekcije.
• Genetske bolesti: Neki ljudi imaju genetske bolesti koje su naslijeđene, zar ne? Bolesti poput te, na primjer , cistična fibroza.Ovaj PCR se također koristi za dijagnosticiranje stanja poput Huntingtonove bolesti i sindroma fragilnog X. To su vrlo složena stanja, tako da je rano otkrivanje vrlo važno za liječenje.
• Vrste raka: Ova metoda također pomaže u identifikaciji određenih vrsta raka, poput limfoma .
• Promjene gena kod raka: Prilikom liječenja osobe oboljele od raka, ovaj PCR test može također otkriti specifične varijacije/mutacije gena u tim ćelijama raka. To će omogućiti korištenje ciljane terapije za ciljano djelovanje na te specifične promjene. Ovo je veliki napredak u području liječenja raka.
• Rizik od budućih bolesti: Osobe s određenim genetskim promjenama mogu biti izložene većem riziku od razvoja ozbiljnih bolesti poput raka u budućnosti. Ovaj PCR se također koristi za genetsko testiranje rizika od raka . To vam omogućava da budete unaprijed svjesni i da po potrebi promijenite način života ili da ostanete oprezni redovnim testiranjem.
• Prenatalno testiranje: PCR je također koristan u testovima koji se provode kako bi se utvrdilo ima li nerođeno dijete trudnice genetsko oboljenje.

Ne samo to, možda ste to vidjeli u filmovima, gdje se uzimaju DNK dokazi, poput male dlake ili mrlje krvi pronađene na mjestu zločina, i koriste za identifikaciju kriminalca. Forenzičke laboratorije također koriste ovu PCR tehnologiju za povećanje količine DNK i provođenje testova.

Koji su testovi i metode koje koriste PCR tehnologiju?

PCR tehnologija se koristi u raznim metodama testiranja. Vrsta testa za koji trebate uzeti uzorak ovisit će o tome za šta testirate. Evo nekoliko primjera:

• Krvne pretrage: Uzima se uzorak krvi i PCR se koristi za otkrivanje genetskih promjena i određenih zaraznih bolesti.
• Bris nazofarinksa: Uzorak sluzi uzet iz unutrašnjosti nosa ili grla može se koristiti za testiranje respiratornih infekcija poput gripe, COVID-19 i RSV-a. To smo svi iskusili tokom COVID-a.
• Preimplantacijska genetska dijagnoza (PGD) ili preimplantacijsko genetsko testiranje (PGS): Tokom procesa in vitro oplodnje (IVF) , uzima se nekoliko ćelija iz embriona i testira se na genetska stanja prije nego što se implantiraju u majčinu maternicu. To se obično radi nekoliko dana nakon vađenja jajnih ćelija.
• Amniocenteza:Tokom trudnoće, mala količina amnionske tečnosti koja okružuje bebu u majčinoj maternici može se koristiti za testiranje genetskog statusa bebe pomoću PCR-a. Ovaj test provodi ljekar specijalista.
• Biopsija: Za identifikaciju genetskih mutacija u ćelijama raka (molekularno testiranje) uzima se mali uzorak tumora (biopsija tumora) ili biopsija koštane srži. Ovo je kao manja operacija. Uzorak se zatim koristi za izvođenje PCR-a kako bi se pronašle genetske promjene.

Kako se pripremate za ovaj test?

U većini slučajeva, PCR test ne zahtijeva posebnu pripremu. Međutim, to zavisi od toga šta testirate i koja se metoda koristi za prikupljanje uzorka. Na primjer, neki testovi krvi mogu zahtijevati da postite nekoliko sati prije. Stoga je najbolje pitati svog ljekara ili centar za testiranje da li postoji nešto posebno što trebate učiniti.

Kako PCR funkcioniše? Malo nauke!

Ovo je pomalo naučna priča, ali dozvolite mi da je objasnim jednostavno. PCR radi da identifikuje sekvencu koja je jedinstvena za DNK koju želite da tražite, odnosno specifična za nju. Ova sekvenca može biti specifična genetska promjena kod raka ili može biti genetski kod virusa ili bakterije. To se naziva ciljna DNK .

Naziv "lančana reakcija polimeraze" odnosi se na proces kojim se u laboratoriji pravi (amplificira) veliki broj kopija ciljne DNK. Ovaj proces koristi enzim koji se zove DNK polimeraza . Ovaj enzim pravi kopije ciljne DNK, ako je prisutna u uzorku.

Ova "lančana reakcija" se javlja kada rastvor prolazi kroz mnogo ciklusa zagrijavanja i hlađenja. U jednom ciklusu, količina DNK se može udvostručiti. Zamislite to kao jedan do dva, dva do četiri, četiri do osam... i tako dalje, na kraju praveći milione kopija. Prednost ovoga je što PCR može detektovati čak i male količine DNK ili RNK koje bi inače bile propuštene drugim testovima.

Često, nakon što se PCR završi, naučnici moraju uraditi više testova kako bi analizirali amplificiranu DNK. Ali ponekad se tokom PCR procesa u rastvor dodaju posebne oznake koje mogu utvrditi da li je uzorak pozitivan ili negativan. Ova metoda se može koristiti za brzo dobijanje rezultata, posebno kada se traže infekcije poput virusa.

Koje vrste PCR-a postoje?

Postoje različite vrste PCR-a. Neke zahtijevaju dodatne korake za kopiranje ili analizu DNK. Pogledajmo dvije glavne vrste:

1. PCR s reverznom transkriptazom (RT-PCR)

Zamislite da se genetska informacija koju želimo kopirati i tražiti ne nalazi u DNK, već u RNK. (Na primjer, virus Covid-19 ima RNK). Zatim se u ovoj RT-PCR analizi RNK (RNA) prvo pretvara u DNK pomoću posebnog enzima (reverzne transkriptaze). DNK koja se formira naziva se komplementarna DNK (cDNK) . Nakon toga se provodi normalan PCR proces spomenut ranije. Jer, normalna PCR se može uraditi samo na DNK.

2. PCR u realnom vremenu / Kvantitativna PCR (Q-PCR)

U ovom slučaju, kako se prave kopije DNK, dodaju se posebne fluorescentne oznake . Ove oznake emituju svjetlost kada se vežu za ciljnu DNK. Zatim, bez dodatnog testiranja, oni koji rade test mogu u realnom vremenu vidjeti da li je relevantna DNK prisutna u uzorku. Ne samo to, već mogu dobiti i kvantitativnu predstavu o tome koliko je prisutno.

Zbunjujuće je to što neki ljudi ovo nazivaju i "RT-PCR". Ali to nije isto što i PCR s reverznom transkriptazom spomenut ranije. Također, ova metoda PCR-a u realnom vremenu može se koristiti u kombinaciji s PCR-om s reverznom transkriptazom spomenutim ranije. Tada se naziva RT-PCR u realnom vremenu (real-time RT-PCR) . Ova metoda RT-PCR-a u realnom vremenu koristi se za testove brisa nosa za otkrivanje RNA virusa poput Covid-19 i gripe.

Šta nam govore rezultati PCR testa?

Kada dobijete rezultate PCR testa, formulacija se može malo razlikovati, ovisno o tome na šta ste testirani.

• Općenito, ako vaš rezultat kaže "otkriveno" ili "prisutno", to znači da imate genetsku mutaciju ili infekciju koju je test tražio.
• Ako rezultat kaže "nije detektovano", to znači da test nije uspio pronaći ciljnu DNK ili RNK koja je testirana. Međutim, u slučaju infekcije, to ponekad može značiti da ste testirali prerano u procesu infekcije. Možda još uvijek imate infekciju, ali možda u tom trenutku nema dovoljno virusa ili bakterija da bi se PCR-om detektovala.

Kako interpretirati PCR rezultate za Covid-19?

Ovo je nešto s čime su mnogi ljudi sada upoznati.

• Pozitivan COVID PCR rezultat - što znači da u vašem izvještaju piše "Otkriveno" - znači da ste vjerovatno zaraženi COVID-19 ili ste se nedavno oporavili od COVID-19 (ponekad PCR može ostati pozitivan neko vrijeme nakon oporavka).
• Ako dobijete negativan ("Nije detektovano") COVID PCR rezultat, to znači da najvjerovatnije niste imali COVID-19 kada ste uzimali bris iz nosa. Međutim, kao što sam ranije spomenuo, ponekad, u ranoj fazi infekcije, posebno ako ste asimptomatski, PCR testovi mogu biti negativni. Dakle, ako imate simptome, vaš ljekar vam može savjetovati da se ponovo testirate za nekoliko dana.

Koliko dugo traje dobijanje PCR rezultata?

Ovo također varira ovisno o testu koji se izvodi.

• Testovi nazalnog brisa za uobičajene viruse poput gripe i COVID-19 obično traju nekoliko sati ili dan da bi se dobili rezultati.
• Genetski testovi koji koriste krvne pretrage i metode biopsije mogu potrajati sedmicu ili više da bi se dobili rezultati jer je proces analize malo složeniji.

Kada trebate posjetiti ljekara?

Ako imate bilo kakvih pitanja ili nedoumica u vezi s PCR testom ili njegovim rezultatima, obavezno razgovarajte sa svojim ljekarom. On vam može sve objasniti.

Najvažnija poruka koju treba ponijeti kući

Iako su riječi "PCR test" iznenada ušle u našu svakodnevnu konverzaciju tokom pandemije COVID-19 iz 2020. godine, to je zapravo vrlo vrijedna tehnologija koju ljekari koriste decenijama. PCR pomaže u identifikaciji i kopiranju malih količina DNK ili RNK, što se može koristiti za dijagnosticiranje raznih zdravstvenih stanja.

Iako je ovo uobičajeno za doktore, možda nije uobičajeno da vi uradite test. Razumijemo to. Ali najbolje je što je potreban samo mali uzorak vašeg tijela, a postupak obično traje samo nekoliko minuta. Ako imate bilo kakvih pitanja, nedoumica ili nedoumica u vezi s ovim, obratite se svom doktoru. On će vam sve objasniti. Ostanite zdravi!

PCR test, DNK, RNK, genetsko testiranje, dijagnoza, Covid-19, virus