Dozvieme sa o PCR teste jednoducho, ako od kamaráta!

Možno si spomínate, že počas pandémie Covid-19 sme všetci hovorili o PCR teste . Niektorí ľudia sa museli trochu báť, keď si predstavovali tyčinku zapichnutú do nosa. Ale čo vlastne je tento PCR test? Dokáže odhaliť iba Covid-19? Nie, PCR je veľmi dôležitá testovacia metóda v medicíne, ktorá pomáha s mnohými vecami. Poďme si o tom dnes hovoriť jednoducho a jasne, akoby sme sa rozprávali s dobrým priateľom.

Čo je PCR? Môžete to trochu vysvetliť?

Jednoducho povedané, PCR je skratka pre polymerázovú reťazovú reakciu . Používa sa na detekciu genetického materiálu v našom tele, či už DNA alebo RNA . Predstavte si malú vzorku, ktorá vám bude odobratá, môže to byť kvapka krvi alebo výter z vnútra vášho nosa. Tento malý kúsok DNA alebo RNA z tejto vzorky sa odoberie a v laboratóriu sa vytvoria milióny, možno miliardy kópií. Toto vedci nazývajú amplifikácia , čo znamená „zväčšovanie“ alebo „násobenie“. Je to ako keby ste pomocou kopírky vytvorili veľa kópií z jedného listu papiera.

Vytvorením mnohých takýchto kópií je pre vedcov jednoduchšie študovať DNA alebo RNA v pôvodnej malej vzorke a zistiť, či sa v nej nachádza niečo zvláštne. PCR patrí do skupiny testov nazývaných testy amplifikácie nukleových kyselín (NAAT) .

Hoci mnoho ľudí počulo slovo PCR v súvislosti s testovaním na Covid-19, táto technológia sa v medicíne používa už dlho a je veľmi užitočnou metódou.

Čo sa dá zistiť pomocou PCR?

Pozrime sa teraz, čo dokáže tento PCR test odhaliť. Mnoho ľudí si myslí, že je určený len na Covid-19. Ale nie je to tak. Pozrite sa:

• Infekčné choroby: PCR môže pomôcť určiť, či je horúčka, prechladnutie alebo kašeľ, ktorý máte, spôsobený vírusom , baktériou , plesňou alebo parazitom . Napríklad:
• Vírus SARS-CoV-2 , ktorý spôsobuje ochorenie COVID-19 (COVID-19) .
• Chrípka , tak bežne nazývame chrípku.
• Respiračný syncyciálny vírus (RSV), ktorý je obzvlášť častý u malých detí.
• Baktérie, ktoré spôsobujú tuberkulózu.
• Mnoho ďalších vírusových a bakteriálnych infekcií.
• Genetické choroby: Niektorí ľudia majú genetické choroby, ktoré sú dedičné, však? Choroby ako táto, napríklad cystická fibróza.Táto PCR sa používa aj na diagnostiku ochorení, ako je Huntingtonova choroba a syndróm fragilného X. Ide o veľmi zložité ochorenia, takže včasná detekcia je pre liečbu veľmi dôležitá.
• Typy rakoviny: Táto metóda tiež pomáha identifikovať určité typy rakoviny, ako napríklad lymfóm .
• Génové zmeny pri rakovine: Pri liečbe osoby s rakovinou dokáže tento PCR test odhaliť aj špecifické génové variácie/mutácie v týchto rakovinových bunkách. To umožní cielenú terapiu zameranú na tieto špecifické zmeny. Ide o významný pokrok v oblasti liečby rakoviny.
• Riziko ochorenia v budúcnosti: Ľudia s určitými genetickými zmenami môžu mať v budúcnosti vyššie riziko vzniku závažných ochorení, ako je rakovina. Táto PCR sa používa aj na genetické testovanie rizika rakoviny . To vám umožňuje byť si v predstihu vedomí a v prípade potreby zmeniť životný štýl alebo zostať ostražití pravidelným testovaním.
• Prenatálne testovanie: PCR je tiež užitočná pri testoch vykonávaných na zistenie, či nenarodené dieťa tehotnej ženy má genetickú poruchu.

Nielen to, možno ste to videli vo filmoch, kde sa odoberú dôkazy DNA, ako napríklad malý vlas alebo krvná škvrna nájdená na mieste činu, a použijú sa na identifikáciu páchateľa. Forenzné laboratóriá tiež používajú túto PCR technológiu na zvýšenie množstva DNA a vykonávanie testov.

Aké testy a metódy využívajú PCR technológiu?

Technológia PCR sa používa v rôznych testovacích metódach. Typ testu, na ktorý je potrebné odobrať vzorku, bude závisieť od toho, na čo testujete. Tu je niekoľko príkladov:

• Krvné testy: Odoberie sa vzorka krvi a PCR sa použije na detekciu genetických zmien a niektorých infekčných chorôb.
• Výter z nosohltanu: Vzorka hlienu odobratá z vnútra nosa alebo hrdla sa môže použiť na testovanie respiračných infekcií, ako je chrípka, COVID-19 a RSV. Toto sme všetci zažili počas COVIDu.
• Preimplantačná genetická diagnostika (PGD) alebo preimplantačný genetický skríning (PGS): Počas procesu oplodnenia in vitro (IVF) sa z embryí odoberie niekoľko buniek a testuje sa na genetické ochorenia pred ich implantáciou do maternice matky. Zvyčajne sa to robí niekoľko dní po odbere vajíčok.
• Amniocentéza:Počas tehotenstva sa malé množstvo plodovej vody obklopujúcej dieťa v matkinom lone môže použiť na testovanie genetického stavu dieťaťa pomocou PCR. Ide o test vykonávaný špecializovaným lekárom.
• Biopsia: Na identifikáciu genetických mutácií v rakovinových bunkách (molekulárne testovanie) sa odoberie malá vzorka nádoru (biopsia nádoru) alebo biopsia kostnej drene. Je to podobné menšiemu chirurgickému zákroku. Vzorka sa potom použije na vykonanie PCR na hľadanie genetických zmien.

Ako sa pripravujete na tento test?

Vo väčšine prípadov sa na PCR test nevyžaduje žiadna špeciálna príprava. Záleží však na tom, na čo sa testujete a aká metóda sa použije na odber vzorky. Napríklad niektoré krvné testy môžu vyžadovať, aby ste sa pred vykonaním niekoľkých hodín postili. Preto je najlepšie opýtať sa svojho lekára alebo testovacieho zariadenia, či je potrebné urobiť niečo špeciálne.

Ako funguje PCR? Trochu vedy!

Je to trochu vedecký príbeh, ale dovoľte mi to vysvetliť jednoducho. PCR identifikuje sekvenciu, ktorá je jedinečná pre DNA, ktorú chcete hľadať, teda špecifická pre ňu. Táto sekvencia môže byť špecifickou genetickou zmenou v rakovine alebo to môže byť genetický kód vírusu alebo baktérie. Toto sa nazýva cieľová DNA .

Názov „polymerázová reťazová reakcia“ označuje proces, pri ktorom sa v laboratóriu vytvára (amplifikuje) veľké množstvo kópií cieľovej DNA. Tento proces využíva enzým nazývaný DNA polymeráza . Tento enzým vytvára kópie cieľovej DNA, ak je prítomná vo vzorke.

Táto „reťazová reakcia“ nastáva, keď roztok prechádza mnohými cyklami zahrievania a chladenia. V jednom cykle sa množstvo DNA môže zdvojnásobiť. Predstavte si to ako jeden ku dvom, dva ku štyrom, štyri k ôsmim... a tak ďalej, pričom sa nakoniec vytvoria milióny kópií. Výhodou je, že PCR dokáže detegovať aj malé množstvá DNA alebo RNA, ktoré by inak iné testy prehliadli.

Vedci často po PCR musia vykonať ďalšie testy na analýzu amplifikovanej DNA. Niekedy sa však počas procesu PCR do roztoku pridávajú špeciálne značky, ktoré dokážu určiť, či je vzorka pozitívna alebo negatívna. Táto metóda sa dá použiť na rýchle získanie výsledkov, najmä pri hľadaní infekcií, ako sú vírusy.

Aké typy PCR existujú?

Existujú rôzne typy PCR. Niektoré vyžadujú ďalšie kroky na kopírovanie alebo analýzu DNA. Pozrime sa na dva hlavné typy:

1. PCR s reverznou transkriptázou (RT-PCR)

Predstavte si, že genetická informácia, ktorú chceme kopírovať a hľadať, nie je v DNA, ale v RNA. (Napríklad vírus Covid-19 má RNA). Potom sa pri tejto RT-PCR RNA (RNA) najprv premení na DNA pomocou špeciálneho enzýmu (reverznej transkriptázy). Vytvorená DNA sa nazýva komplementárna DNA (cDNA) . Potom sa vykoná bežný proces PCR, ktorý bol spomenutý vyššie. Pretože bežná PCR sa dá vykonať iba na DNA.

2. PCR v reálnom čase / Kvantitatívna PCR (Q-PCR)

Pri tomto postupe sa pri vytváraní kópií DNA pridávajú špeciálne fluorescenčné značky . Tieto značky po naviazaní na cieľovú DNA vyžarujú svetlo. Potom môžu tí, ktorí test vykonávajú, v reálnom čase vidieť, či je relevantná DNA vo vzorke prítomná, bez ďalšieho testovania. Nielen to, ale môžu získať aj kvantitatívnu predstavu o tom, koľko je jej prítomné.

Mätúce je, že niektorí ľudia to nazývajú aj „RT-PCR“. Nie je to však to isté ako PCR s reverznou transkriptázou, ktorá bola spomenutá vyššie. Túto metódu PCR v reálnom čase možno použiť aj v kombinácii s PCR s reverznou transkriptázou, ktorá bola spomenutá vyššie. Vtedy sa nazýva RT-PCR v reálnom čase (real-time RT-PCR) . Táto metóda RT-PCR v reálnom čase sa používa na testy nosových výterov na detekciu RNA vírusov, ako je Covid-19 a chrípka.

Čo nám hovoria výsledky PCR testu?

Keď dostanete výsledky PCR testu, znenie sa môže mierne líšiť v závislosti od toho, na čo ste boli testovaní.

• Vo všeobecnosti, ak váš výsledok hovorí „zistené“ alebo „prítomné“, znamená to, že máte genetickú mutáciu alebo infekciu, ktorú test hľadal.
• Ak výsledok ukazuje „nedetekované“, znamená to, že test nedokázal nájsť testovanú cieľovú DNA alebo RNA. V prípade infekcie to však niekedy môže znamenať, že ste test vykonali príliš skoro v procese infekcie. Infekciu môžete stále mať, ale v tom čase už nemusí byť dostatok vírusu alebo baktérií na to, aby sa dali pomocou PCR zistiť.

Ako interpretovať výsledky PCR na Covid-19?

Toto je niečo, s čím je teraz veľa ľudí oboznámených.

• Pozitívny výsledok PCR testu na COVID – čo znamená, že vo vašej správe je uvedené „Zistené“ – znamená, že ste pravdepodobne infikovaný vírusom COVID-19 alebo ste sa nedávno zotavili z COVID-19 (PCR môže niekedy zostať pozitívny ešte nejaký čas po zotavení).
• Ak dostanete negatívny výsledok PCR testu na COVID („Nezistené“), znamená to, že ste s najväčšou pravdepodobnosťou nemali COVID-19 v čase odberu nosového výteru. Ako som však už spomenul, niekedy, na začiatku infekcie, najmä ak ste asymptomatickí, môžu byť PCR testy negatívne. Ak teda máte príznaky, lekár vám môže odporučiť, aby ste sa o niekoľko dní dali znova otestovať.

Ako dlho trvá získanie výsledkov PCR?

Toto sa tiež líši v závislosti od vykonávaného testu.

• Testy nosových výterov na bežné vírusy, ako je chrípka a COVID-19, zvyčajne trvajú niekoľko hodín alebo deň, kým sa dosiahnu výsledky.
• Genetické testy, ktoré využívajú krvné testy a biopsiu, môžu trvať týždeň alebo dlhšie , kým sa dosiahnu výsledky, pretože proces analýzy je o niečo zložitejší.

Kedy potrebujete navštíviť lekára?

Ak máte akékoľvek otázky alebo obavy týkajúce sa PCR testu alebo jeho výsledkov, určite sa poraďte so svojím lekárom. Ten vám všetko vysvetlí.

Najdôležitejšie posolstvo, ktoré si treba odniesť domov

Hoci slová „PCR test“ sa zrazu dostali do našej každodennej konverzácie s pandémiou COVID-19 v roku 2020, v skutočnosti ide o veľmi cennú technológiu, ktorú lekári používajú už desaťročia. PCR pomáha identifikovať a kopírovať malé množstvá DNA alebo RNA, ktoré možno použiť na diagnostikovanie rôznych zdravotných problémov.

Aj keď je to u lekárov bežné, u vás nemusí byť bežné absolvovať test. Chápeme to. Najlepšie na tom však je, že vyžaduje len malú vzorku vášho tela a zákrok zvyčajne trvá len niekoľko minút. Ak máte akékoľvek otázky, obavy alebo pochybnosti ohľadom tohto, poraďte sa so svojím lekárom. Všetko vám vysvetlí. Zostaňte zdraví!

PCR test, DNA, RNA, genetické testovanie, diagnostika, Covid-19, vírus