Spoznajmo PCR test preprosto, kot od prijatelja!

Morda se spomnite, da smo med pandemijo covida-19 vsi govorili o testu PCR . Nekateri so se verjetno malo bali, ko so pomislili na palčko, vstavljeno v nos. Kaj pa točno je ta test PCR? Ali lahko odkrije samo covid-19? Ne, PCR je zelo pomembna testna metoda v medicini, ki pomaga pri marsičem. Pogovorimo se o vsem tem danes, preprosto in jasno, kot da bi se pogovarjali z dobrim prijateljem.

Kaj je PCR? Ali lahko malo razložite?

Preprosto povedano, PCR je okrajšava za verižno reakcijo s polimerazo . Uporablja se za odkrivanje genskega materiala v našem telesu, bodisi DNK bodisi RNK . Predstavljajte si majhen vzorec, ki vam ga vzamejo, lahko je to kapljica krvi ali bris z notranjosti nosu. Ta droben košček DNK ali RNK v tem vzorcu se vzame in v laboratoriju se naredijo milijoni, morda milijarde kopij. To znanstveniki imenujejo amplifikacija , kar pomeni »povečanje« ali »množenje«. To je kot narediti veliko kopij enega samega lista papirja s fotokopirnim strojem.

Z izdelavo številnih takšnih kopij znanstvenikom olajšajo preučevanje DNK ali RNK v originalnem majhnem vzorcu in ugotavljanje, ali je v njem kaj posebnega. PCR spada v skupino testov, imenovanih testi amplifikacije nukleinskih kislin (NAAT) .

Čeprav so mnogi ljudje slišali besedo PCR v povezavi s testiranjem na Covid-19, se ta tehnologija v medicini uporablja že dolgo in je zelo uporabna metoda.

Kaj je mogoče odkriti s PCR?

Zdaj pa poglejmo, kaj vse lahko zazna ta PCR test. Mnogi mislijo, da je namenjen samo za Covid-19. Vendar to ne drži. Poglejte si:

• Nalezljive bolezni: PCR lahko pomaga ugotoviti, ali vročino, prehlad ali kašelj povzroča virus , bakterija , gliva ali parazit . Na primer:
• Virus SARS-CoV-2 , ki povzroča COVID-19 (COVID-19) .
• Gripa , tako običajno rečemo gripi.
• Respiratorni sincicijski virus (RSV), ki je še posebej pogost pri majhnih dojenčkih.
• Bakterije, ki povzročajo tuberkulozo.
• Številne druge virusne in bakterijske okužbe.
• Genetske bolezni: Nekateri ljudje imajo genetske bolezni, ki so podedovane, kajne? Takšne bolezni, na primer cistična fibroza.Ta PCR se uporablja tudi za diagnosticiranje stanj, kot sta Huntingtonova bolezen in sindrom fragilnega X. To so zelo zapletena stanja, zato je zgodnje odkrivanje zelo pomembno za zdravljenje.
• Vrste raka: Ta metoda pomaga tudi pri prepoznavanju določenih vrst raka, kot je limfom .
• Genske spremembe pri raku: Pri zdravljenju osebe z rakom lahko ta PCR test zazna tudi specifične genske variacije/mutacije v teh rakavih celicah. To bo omogočilo uporabo ciljno usmerjene terapije za ciljanje teh specifičnih sprememb. To je velik napredek na področju zdravljenja raka.
• Tveganje za prihodnje bolezni: Ljudje z določenimi genetskimi spremembami imajo lahko večje tveganje za razvoj resnih bolezni, kot je rak, v prihodnosti. Ta PCR se uporablja tudi za genetsko testiranje tveganja za raka . To vam omogoča, da ste vnaprej pozorni in po potrebi spremenite življenjski slog ali ostanete pozorni z rednim testiranjem.
• Prenatalno testiranje: PCR je koristen tudi pri testih, ki se izvajajo za ugotavljanje, ali ima nerojeni otrok nosečnice genetsko bolezen.

Ne samo to, morda ste to že videli v filmih, kjer se odvzamejo dokazi DNK, kot so droben las ali madež krvi, najden na kraju zločina, in se uporabijo za identifikacijo storilca. Forenzični laboratoriji uporabljajo to tehnologijo PCR tudi za povečanje količine DNK in izvajanje testov.

Kateri testi in metode uporabljajo tehnologijo PCR?

Tehnologija PCR se uporablja v različnih metodah testiranja. Vrsta testa, za katerega morate vzeti vzorec, bo odvisna od tega, za kaj testirate. Tukaj je nekaj primerov:

• Krvne preiskave: Odvzame se vzorec krvi in ​​se uporabi PCR za odkrivanje genetskih sprememb in nekaterih nalezljivih bolezni.
• Bris nazofarinksa: Vzorec sluzi, odvzet iz notranjosti nosu ali grla, se lahko uporabi za testiranje na okužbe dihal, kot so gripa, COVID-19 in RSV. To smo vsi doživeli med COVID-om.
• Predimplantacijska genetska diagnoza (PGD) ali predimplantacijsko genetsko testiranje (PGS): Med postopkom oploditve in vitro (IVF) se iz zarodkov odvzame nekaj celic in se testira na genetske bolezni, preden se vsadijo v materino maternico. To se običajno opravi nekaj dni po odvzemu jajčec.
• Amniocenteza:Med nosečnostjo se lahko majhna količina amnijske tekočine, ki obdaja otroka v maternici, uporabi za testiranje otrokovega genetskega statusa z uporabo PCR. To je test, ki ga opravi zdravnik specialist.
• Biopsija: Za identifikacijo genetskih mutacij v rakavih celicah (molekularno testiranje) se odvzame majhen vzorec tumorja (biopsija tumorja) ali biopsija kostnega mozga. To je podobno manjšemu kirurškemu posegu. Vzorec se nato uporabi za izvedbo PCR za iskanje genetskih sprememb.

Kako se pripravite na ta test?

V večini primerov za PCR test ni potrebna posebna priprava. Vendar je odvisno od tega, kaj testirate in katera metoda se uporablja za odvzem vzorca. Na primer, nekateri krvni testi lahko zahtevajo, da se nekaj ur pred tem postite. Zato je najbolje, da se posvetujete z zdravnikom ali v testni ustanovi, če morate storiti kaj posebnega.

Kako deluje PCR? Malo znanosti!

To je nekoliko znanstvena zgodba, vendar naj jo razložim preprosto. PCR identificira zaporedje, ki je edinstveno za DNK, ki jo želite iskati, torej specifično zanjo. To zaporedje je lahko specifična genetska sprememba pri raku ali pa genetska koda virusa ali bakterije. To se imenuje ciljna DNK .

Ime "verižna reakcija s polimerazo" se nanaša na postopek, s katerim se v laboratoriju naredi (pomnoži) veliko število kopij ciljne DNK. Ta postopek uporablja encim, imenovan DNK polimeraza . Ta encim naredi kopije ciljne DNK, če je ta prisotna v vzorcu.

Do te »verižne reakcije« pride, ko raztopina gre skozi več ciklov segrevanja in ohlajanja. V enem ciklu se lahko količina DNK podvoji. Predstavljajte si to kot ena proti dve, dve proti štiri, štiri proti osem ... in tako naprej, sčasoma nastanejo milijoni kopij. Prednost tega je, da lahko PCR zazna celo majhne količine DNK ali RNK, ki bi jih drugi testi sicer spregledali.

Pogosto morajo znanstveniki po opravljeni PCR opraviti še več testov za analizo amplificirane DNK. Včasih pa se med postopkom PCR raztopini dodajo posebne oznake, ki lahko ugotovijo, ali je vzorec pozitiven ali negativen. To metodo je mogoče uporabiti za hitro pridobivanje rezultatov, zlasti pri iskanju okužb, kot so virusi.

Katere vrste PCR obstajajo?

Obstajajo različne vrste PCR. Nekatere zahtevajo dodatne korake za kopiranje ali analizo DNK. Oglejmo si dve glavni vrsti:

1. PCR z reverzno transkriptazo (RT-PCR)

Predstavljajte si, da genetske informacije, ki jih želimo kopirati in iskati, niso v DNK, temveč v RNK. (Na primer, virus Covid-19 ima RNK). Nato se pri tej RT-PCR RNK (RNA) najprej pretvori v DNK s posebnim encimom (reverzna transkriptaza). Nastala DNK se imenuje komplementarna DNK (cDNK) . Nato se izvede običajni postopek PCR, omenjen prej. Ker se običajna PCR lahko izvede samo na DNK.

2. PCR v realnem času / kvantitativna PCR (Q-PCR)

Pri tem se zgodi, da se med izdelavo kopij DNK dodajo posebne fluorescentne oznake . Te oznake oddajajo svetlobo, ko se vežejo na ciljno DNK. Nato lahko tisti, ki izvajajo test, brez dodatnega testiranja v realnem času vidijo, ali je ustrezna DNK prisotna v vzorcu. Poleg tega lahko dobijo tudi kvantitativno predstavo o tem, koliko je prisotne.

Zmedeno je, da nekateri to imenujejo tudi "RT-PCR". Vendar to ni isto kot prej omenjena PCR z reverzno transkriptazo. To metodo PCR v realnem času je mogoče uporabiti tudi v kombinaciji s prej omenjeno PCR z reverzno transkriptazo. Potem se imenuje RT-PCR v realnem času (real-time RT-PCR) . Ta metoda RT-PCR v realnem času se uporablja za teste nosnih brisov za odkrivanje virusov RNA, kot sta Covid-19 in gripa.

Kaj nam povedo rezultati PCR testa?

Ko prejmete rezultate PCR testa, se lahko besedilo nekoliko razlikuje, odvisno od tega, za kaj ste bili testirani.

• Na splošno, če vaš rezultat kaže "zaznano" ali "prisotno", to pomeni, da imate genetsko mutacijo ali okužbo, ki jo je test iskal.
• Če rezultat kaže »ni zaznano«, to pomeni, da test ni mogel najti ciljne DNK ali RNK, ki je bila testirana. Vendar pa lahko v primeru okužbe to včasih pomeni, da ste test opravili prezgodaj v procesu okužbe. Morda ste še vedno okuženi, vendar takrat morda ni dovolj virusa ali bakterij, da bi jih PCR odkril.

Kako interpretirati rezultate PCR za Covid-19?

To je nekaj, kar je mnogim ljudem zdaj znano.

• Pozitiven rezultat PCR testa na COVID – kar pomeni, da v vašem poročilu piše »Odkrito« – pomeni, da ste verjetno okuženi s COVID-19 ali pa ste si pred kratkim opomogli od COVID-19 (včasih lahko PCR ostane pozitiven še nekaj časa po okrevanju).
• Če dobite negativen rezultat PCR testa za COVID (»Ni zaznano«), to pomeni, da najverjetneje niste imeli COVID-19, ko ste odvzeli bris nosu. Vendar pa so, kot sem že omenil, včasih, v zgodnji fazi okužbe, zlasti če ste asimptomatski, testi PCR lahko negativni. Če imate torej simptome, vam bo zdravnik morda svetoval, da se čez nekaj dni ponovno testirate.

Koliko časa traja, da dobim rezultate PCR?

To se razlikuje tudi glede na izvedeni test.

• Testi nosnih brisov za pogoste viruse, kot sta gripa in COVID-19, običajno trajajo nekaj ur ali en dan, da dobijo rezultate.
• Rezultati genetskih testov, ki uporabljajo krvne preiskave in metode biopsije, lahko trajajo teden dni ali več, ker je postopek analize nekoliko bolj zapleten.

Kdaj morate obiskati zdravnika?

Če imate kakršna koli vprašanja ali pomisleke glede testa PCR ali njegovih rezultatov, se posvetujte s svojim zdravnikom. Vse vam lahko razloži.

Najpomembnejše sporočilo, ki ga morate odnesti domov

Čeprav je beseda "PCR test" nenadoma vstopila v naš vsakdanji pogovor s pandemijo COVID-19 leta 2020, gre v resnici za zelo dragoceno tehnologijo, ki jo zdravniki uporabljajo že desetletja. PCR pomaga identificirati in kopirati majhne količine DNK ali RNK, ki jih je mogoče uporabiti za diagnosticiranje različnih zdravstvenih stanj.

Čeprav je to za zdravnike običajno, morda ni običajno, da opravite test. To razumemo. Najboljše pa je, da zahteva le majhen vzorec vašega telesa in postopek običajno traja le nekaj minut. Če imate kakršna koli vprašanja, pomisleke ali dvome o tem, se posvetujte s svojim zdravnikom. Vse vam bo razložil. Ostanite zdravi!

PCR test, DNK, RNA, genetsko testiranje, diagnoza, Covid-19, virus