Co je PCR test? Pojďme si o tom povědět jednoduše!

Když slyšíme slovo PCR, vybaví se nám pandemie covidu, že? Doba, kdy jsme si museli strčit výtěr do nosu a čekat na výsledky... na to se nikdy nezapomene. Ale věděli jste, že PCR se nepoužívá jen k detekci covidu? Je to ve skutečnosti velmi důležitý test, který způsobil obrovský průlom v lékařské vědě. Pojďme si dnes jednoduše a porozumět tomu, co tento PCR test je, co dalšího dokáže detekovat a jak funguje.

Co je to PCR jednoduše?

Dobře, řekněme to takto. Představte si, že musíte najít jediné slovo na jediné stránce jediné knihy z tisíců knih ve velké knihovně. Jak těžké by to bylo? Je to jako najít malý kousek DNA nebo RNA , genetického materiálu uvnitř buněk v našem těle.

Technologie PCR (polymerázová řetězová reakce) tento obtížný úkol usnadňuje. Ta umožňuje kopírovat nejmenší kousek DNA nebo RNA, který hledáme, stotisíce, ba i milionykrát (amplifikace). Je to jako najít stránku s daným slovem v knihovně, vložit ji do kopírky a udělat asi milion kopií. Poté, co je toto těžko dostupné slovo všude, ho můžeme snadno identifikovat.

Jednoduše řečeno, PCR je test, který odebere velmi malé množství buňky z našeho těla, kapku krve nebo nosní stěr, a v laboratoři do něj uměle vypěstuje specifický kousek DNA nebo RNA, aby se potvrdilo, zda je v našem vzorku přítomen, či nikoli. Jedná se o velmi citlivý test. To znamená, že dokáže detekovat i velmi malá množství viru. Tato metoda patří do skupiny testů zvaných test amplifikace nukleových kyselin (NAAT).

Jaké nemoci lze odhalit pomocí PCR testu?

Přestože se PCR stala populární kvůli pandemii COVID-19, v lékařství se používá již po celá desetiletí. Tímto testem lze zjistit mnoho věcí. Podívejme se na některé z hlavních.

Jak se odebírá vzorek na PCR test?

Způsob odběru vzorku pro PCR test závisí na druhu onemocnění, které hledáte. Metoda odběru vzorku se u každého onemocnění liší.

Většinou se na PCR test nemusíte připravovat nic zvláštního. V některých případech, například při biopsii, vám však lékař předem poskytne potřebné pokyny.

Jak funguje PCR technologie?

Dobře, teď se podívejme, jak tato úžasná technologie vlastně funguje. Je to trochu vědecké, ale vysvětlím to jednoduše.

1. Příprava vzorku: Nejprve se z odebraného vzorku (krve, sekretů atd.) izoluje DNA nebo RNA.

2. Příprava směsi: Poté se tato izolovaná DNA/RNA smíchá s několika speciálními chemikáliemi. Hlavní složkou této směsi je enzym zvaný DNA polymeráza . Ten je hlavním enzymem, který provádí fotokopírování.

3. Cyklus ohřevu a chlazení: Nyní se malá zkumavka s touto směsí umístí do speciálního stroje. Tento stroj velmi rychle zvyšuje a snižuje teplotu.

• Denaturace: Nejprve se teplota zvýší na přibližně 95 stupňů Celsia. To způsobí oddělení dvou řetězců DNA.
• Žíhání: Poté se teplota sníží na přibližně 14 stupňů Celsia. Na oddělené řetězce DNA se připojí malé kousky DNA (primery), které odpovídají hledanému fragmentu DNA.
• Opětovné zahřátí (extenze): Poté se teplota zvýší na přibližně 22 stupňů Celsia. Poté se aktivuje enzym DNA polymeráza a z tohoto primeru vytvoří nový řetězec DNA, který odpovídá původnímu řetězci DNA.

4. Kopírování: Nyní byly vytvořeny dvě kopie jednoho řetězce DNA. Tento teplotní cyklus se opakuje asi 30–40krát. V jednom cyklu se množství DNA zdvojnásobí. Ze dvou se stanou čtyři, ze čtyř osm, z osmi šestnáct... Po zhruba 30 cyklech bylo z původního jediného kousku DNA vytvořeno více než miliarda kopií.

Nyní se tento fragment DNA/RNA, který byl dříve příliš malý na detekci, stal dostatečně velkým na to, aby byl snadno detekovatelný.

Existují různé druhy PCR testů?

Ano, existují hlavně dva typy, kterých si musíme být vědomi.

• PCR s reverzní transkriptázou (RT-PCR): Některé viry, jako je Covid, chřipka a HIV, mají svou genetickou informaci v RNA, nikoli v DNA. Normální PCR dokáže kopírovat pouze DNA. V RT-PCR se tedy nejprve použije speciální enzym („reverzní transkriptáza“) k „přeměně“ této RNA na DNA. Výsledná DNA se nazývá komplementární DNA (cDNA). Poté probíhá normální proces PCR.

• Real-time PCR / Kvantitativní PCR (Q-PCR): Jedná se o o něco pokročilejší metodu. Při kopírování DNA se k ní připojí fluorescenční značka. S rostoucím množstvím kopírované DNA se zvyšuje i tato fluorescence. Přístroj může tuto fluorescenci měřit. Takže zatímco čekáme, tedy v reálném čase , můžeme vidět, zda je relevantní DNA ve vzorku přítomna, či nikoli. Nejen to, ale také může poskytnout hrubou představu o tom, kolik viru bylo v původním vzorku (virová nálož). K detekci Covidu se často používá test RT-PCR v reálném čase , který kombinuje obě tyto metody.

Co znamená PCR zpráva?

Je velmi důležité porozumět PCR zprávě, jakmile ji obdržíte.

• Detekováno / Pozitivní: Pokud vaše zpráva uvádí „Detekováno“ nebo „Pozitivní“, znamená to, že váš vzorek obsahoval části viru nebo genetický materiál, který hledali. Jednoduše řečeno, pravděpodobně máte infekci.

• Nedetekováno / Negativní: To znamená, že relevantní fragmenty DNA/RNA nebyly v testovaném vzorku nalezeny. To znamená, že s největší pravděpodobností danou infekci nemáte.

Doba trvání testu se liší v závislosti na prováděném testu. Výtěry z nosu (jako je COVID, chřipka) obvykle zobrazují výsledky do 24 hodin. Krevní testy a biopsie k vyhledávání genetických onemocnění však mohou trvat týden nebo i déle.

Pokud máte jakékoli dotazy nebo obavy ohledně PCR testu nebo jeho výsledků, nezapomeňte se o tom poraďte se svým lékařem.