Õpime PCR-testi kohta lihtsalt, just nagu sõbralt!

Võib-olla mäletate, et Covid-19 pandeemia ajal rääkisime kõik PCR-testist . Mõned inimesed pidid olema veidi hirmul, mõeldes ninna torgatud pulgale. Aga mis see PCR-test täpselt on? Kas see suudab tuvastada ainult Covid-19-t? Ei, PCR on meditsiinis väga oluline testimismeetod, mis aitab paljude asjade puhul. Räägime sellest kõigest täna lihtsalt ja selgelt, justkui räägiksime hea sõbraga.

Mis on PCR? Kas saaksite seda veidi selgitada?

Lihtsamalt öeldes on PCR lühend polümeraasi ahelreaktsioonist (PCR). Seda kasutatakse meie kehas geneetilise materjali , kas DNA või RNA , tuvastamiseks. Kujutage ette väikest proovi, mis võetakse teilt, see võib olla veretilk või nina seest võetud tampoon. See pisike DNA või RNA tükk selles proovis võetakse ja laboris tehakse miljoneid, võib-olla miljardeid koopiaid. Teadlased nimetavad seda amplifikatsiooniks , mis tähendab "suurendamist" või "korrutamist". See on nagu ühest paberilehest paljude koopiate tegemine koopiamasinaga.

Selliste paljude koopiate tegemisega on teadlastel lihtsam uurida DNA-d või RNA-d algses väikeses proovis ja näha, kas selles on midagi erilist. PCR kuulub testide rühma, mida nimetatakse nukleiinhappe amplifikatsioonitestideks (NAAT) .

Kuigi paljud inimesed on kuulnud sõna PCR seoses Covid-19 testimisega, on seda tehnoloogiat meditsiinivaldkonnas kasutatud juba pikka aega ja see on väga kasulik meetod.

Mida saab PCR-meetodil tuvastada?

Vaatame nüüd, milliseid asju see PCR-test suudab tuvastada. Paljud arvavad, et see on mõeldud ainult Covid-19 jaoks. Aga see pole nii. Vaadake:

• Nakkushaigused: PCR aitab kindlaks teha, kas teie palavik, külmetus või köha on põhjustatud viirusest , bakterist , seenest või parasiidist . Näiteks:
• SARS-CoV-2 viirus, mis põhjustab COVID-19 (COVID-19) .
• Gripp , nii me tavaliselt gripiks nimetame.
• Respiratoorne süntsütiaalviirus (RSV), mis on eriti levinud imikutel.
• Bakter, mis põhjustab tuberkuloosi.
• Paljud muud viirus- ja bakteriaalsed infektsioonid.
• Geneetilised haigused: Mõnel inimesel on pärilikud geneetilised haigused, eks? Näiteks tsüstiline fibroos.Seda PCR-i kasutatakse ka selliste seisundite diagnoosimiseks nagu Huntingtoni tõbi ja fragiilse X-sündroom . Need on väga keerulised seisundid, seega on varajane avastamine ravi jaoks väga oluline.
• Vähiliigid: See meetod aitab tuvastada ka teatud tüüpi vähki, näiteks lümfoomi .
• Geenimuutused vähi korral: Vähihaige ravis saab selle PCR-testiga tuvastada ka spetsiifilisi geenivariatsioone/mutatsioone nendes vähirakkudes. See võimaldab kasutada sihipärast ravi nende spetsiifiliste muutuste sihtimiseks. See on suur edasiminek vähiravi valdkonnas.
• Tulevane haigestumisrisk: Teatud geneetiliste muutustega inimestel võib tulevikus olla suurem risk haigestuda tõsistesse haigustesse, näiteks vähki. Seda PCR-i kasutatakse ka vähiriski geneetiliseks testimiseks . See võimaldab teil olla eelnevalt teadlik ja vajadusel elustiili muuta või püsida valvas, lastes end regulaarselt testida.
• Sünnieelne testimine: PCR on abiks ka testides, mis tehakse selleks, et näha, kas raseda naise sündimata lapsel on geneetiline seisund.

Lisaks olete seda ehk näinud filmides, kus DNA-tõendeid, näiteks kuriteopaigalt leitud pisikesi juuksekarvu või vereplekke, kasutatakse kurjategija tuvastamiseks. Kohtuekspertiisi laborid kasutavad seda PCR-tehnoloogiat samuti DNA hulga suurendamiseks ja testide läbiviimiseks.

Millised testid ja meetodid kasutavad PCR-tehnoloogiat?

PCR-tehnoloogiat kasutatakse mitmesugustes testimismeetodites. Testi tüüp, mille jaoks peate proovi võtma, sõltub sellest, mida te testite. Siin on mõned näited:

• Vereanalüüsid: võetakse vereproov ja PCR-i kasutatakse geneetiliste muutuste ja teatud nakkushaiguste avastamiseks.
• Nina-neelu tampoon: Nina või kurgu seest võetud limaproovi saab kasutada hingamisteede infektsioonide, näiteks gripi, COVID-19 ja RSV, testimiseks. Seda oleme kõik COVIDi ajal kogenud.
• Preimplantatsiooni geneetiline diagnostika (PGD) või preimplantatsiooni geneetiline skriining (PGS): In vitro viljastamise (IVF) protsessi käigus võetakse embrüotest mõned rakud ja testitakse neid geneetiliste seisundite suhtes enne nende siirdamist ema emakasse. Tavaliselt tehakse seda paar päeva pärast munaraku eraldamist.
• Lootevee uuring:Raseduse ajal saab PCR-meetodil lapse geneetilist staatust testida väikese koguse lootevee abil, mis ümbritseb last emaüsas. Selle testi teeb spetsialist.
• Biopsia: Vähirakkude geneetiliste mutatsioonide tuvastamiseks (molekulaarne testimine) võetakse väike proov kasvajast (kasvaja biopsia) või luuüdi biopsia. See on nagu väike operatsioon. Seejärel kasutatakse proovi PCR-i tegemiseks geneetiliste muutuste otsimiseks.

Kuidas selleks testiks valmistuda?

Enamasti ei ole PCR-testiks vaja spetsiaalset ettevalmistust. See sõltub aga sellest, mida te testite ja millist meetodit proovi kogumiseks kasutatakse. Näiteks võivad mõned vereanalüüsid nõuda mõnetunnist paastumist. Seega on kõige parem küsida oma arstilt või testimisasutuselt, kas on midagi erilist, mida peate tegema.

Kuidas PCR töötab? Natuke teadust!

See on natuke teaduslik lugu, aga lubage mul see lihtsalt selgitada. PCR-i abil tuvastatakse otsitava DNA-le ainuomane ehk sellele spetsiifiline järjestus. See järjestus võib olla vähi spetsiifiline geneetiline muutus või viiruse või bakteri geneetiline kood. Seda nimetatakse siht-DNA-ks .

Nimetus "polümeraasi ahelreaktsioon" viitab protsessile, mille käigus laboris tehakse (amplifitseeritakse) suur hulk siht-DNA koopiaid. See protsess kasutab ensüümi nimega DNA polümeraas . See ensüüm teeb siht-DNA koopiaid, kui see proovis leidub.

See "ahelreaktsioon" tekib siis, kui lahus läbib palju kuumutamis- ja jahutamistsükleid. Ühe tsükli jooksul võib DNA hulk kahekordistuda. Mõelge sellele kui üks kahele, kaks neljale, neli kaheksale... ja nii edasi, lõpuks tehes miljoneid koopiaid. Selle eeliseks on see, et PCR suudab tuvastada isegi väikeseid DNA või RNA koguseid, mida teised testid muidu ei märkaks.

Sageli peavad teadlased pärast PCR-i tegemist tegema amplifitseeritud DNA analüüsimiseks täiendavaid teste. Kuid mõnikord lisatakse PCR-i käigus lahusele spetsiaalseid märgiseid, mis näitavad, kas proov on positiivne või negatiivne. Seda meetodit saab kasutada kiirete tulemuste saamiseks, eriti viiruste ja muude infektsioonide otsimisel.

Mis tüüpi PCR-i on olemas?

PCR-i on erinevat tüüpi. Mõned nõuavad DNA kopeerimiseks või analüüsimiseks täiendavaid samme. Vaatleme kahte peamist tüüpi:

1. Pöördtranskriptaasi PCR (RT-PCR)

Kujutage ette, et geneetiline teave, mida me tahame kopeerida ja otsida, ei ole DNA-s, vaid RNA-s. (Näiteks Covid-19 viirusel on RNA). Seejärel tehakse selles RT-PCR -is see, et RNA (RNA) konverteeritakse esmalt spetsiaalse ensüümi (pöördtranskriptaasi) abil DNA-ks. Moodustunud DNA-d nimetatakse komplementaarseks DNA-ks (cDNA) . Pärast seda tehakse eelnevalt mainitud tavaline PCR-protsess. Sest tavalist PCR-i saab teha ainult DNA-ga.

2. Reaalaja PCR / kvantitatiivne PCR (Q-PCR)

Selle käigus lisatakse DNA koopiate tegemisel spetsiaalsed fluorestseeruvad märgised . Need märgised kiirgavad valgust, kui nad seonduvad siht-DNA-ga. Seejärel saavad testi tegijad ilma täiendava testimiseta reaalajas näha, kas proovis on vastav DNA olemas. Lisaks saavad nad kvantitatiivse ettekujutuse sellest, kui palju seda on.

Segadusttekitav on see, et mõned inimesed nimetavad seda ka "RT-PCR-iks". Kuid see ei ole sama, mis varem mainitud pöördtranskriptaasi PCR. Samuti saab seda reaalajas PCR-meetodit kasutada koos varem mainitud pöördtranskriptaasi PCR-iga. Sel juhul nimetatakse seda reaalajas RT-PCR-iks (real-time RT-PCR) . Seda reaalajas RT-PCR-meetodit kasutatakse ninaproovi testimiseks RNA-viiruste, näiteks Covid-19 ja gripi, tuvastamiseks.

Mida PCR-testi tulemused meile ütlevad?

PCR-testi tulemuste saamisel võib sõnastus olla veidi erinev, olenevalt sellest, mille suhtes teid testiti.

• Üldiselt, kui teie tulemus ütleb "tuvastatud" või "esineb", tähendab see, et teil on geneetiline mutatsioon või infektsioon, mida test otsis.
• Kui tulemus näitab „ei tuvastatud“, tähendab see, et test ei suutnud leida testitavat sihtmärk-DNA-d või -RNA-d. Infektsiooni korral võib see aga mõnikord tähendada, et testisite nakkusprotsessi liiga vara. Teil võib küll infektsioon olla, kuid sel ajal ei pruugi olla piisavalt viirust või baktereid, mida PCR-meetodil tuvastada saaks.

Kuidas tõlgendada Covid-19 PCR-i tulemusi?

See on midagi, millega paljud inimesed nüüdseks tuttavad on.

• Positiivne COVID PCR-i tulemus – mis tähendab, et teie aruandes on märge „Tuvastati” – tähendab, et olete tõenäoliselt nakatunud COVID-19-sse või olete hiljuti COVID-19-st paranenud (mõnikord võib PCR jääda positiivseks veel mõnda aega pärast paranemist).
• Kui saate negatiivse ("Mitte tuvastatud") COVID PCR-tulemuse, tähendab see, et teil tõenäoliselt ei olnud ninaproovi võtmise ajal COVID-19-d . Nagu ma aga varem mainisin, võivad PCR-testid nakkuse algstaadiumis, eriti kui teil pole sümptomeid, olla negatiivsed. Seega, kui teil on sümptomeid, võib arst soovitada teil mõne päeva pärast uuesti testida.

Kui kaua PCR-i tulemuste saamine aega võtab?

See varieerub ka sõltuvalt tehtavast testist.

• Ninaproovi testid tavaliste viiruste, näiteks gripi ja COVID-19 suhtes, annavad tulemusi tavaliselt mõne tunni või päeva jooksul .
• Vereanalüüse ja biopsiameetodeid kasutavate geneetiliste testide tulemuste saamine võib võtta nädal või rohkem, kuna analüüsiprotsess on veidi keerulisem.

Millal on vaja arsti juurde pöörduda?

Kui teil on PCR-testi või selle tulemuste kohta küsimusi või muresid, pidage kindlasti nõu oma arstiga. Ta saab teile kõike selgitada.

Kõige olulisem sõnum, mida koju kaasa võtta

Kuigi sõnad "PCR-test" jõudsid meie igapäevasesse vestlusse ootamatult seoses 2020. aasta COVID-19 pandeemiaga, on see tegelikult väga väärtuslik tehnoloogia, mida arstid on kasutanud aastakümneid. PCR aitab tuvastada ja kopeerida väikeseid koguseid DNA-d või RNA-d, mida saab kasutada mitmesuguste terviseseisundite diagnoosimiseks.

Kuigi arstide puhul on see tavaline, ei pruugi see olla teie jaoks tavaline. Me mõistame seda. Kuid parim on see, et see nõuab vaid väikest proovi teie kehast ja protseduur võtab tavaliselt vaid paar minutit. Kui teil on selle kohta küsimusi, muresid või kahtlusi, pidage palun nõu oma arstiga. Ta selgitab teile kõike. Püsige terved!

PCR -test, DNA, RNA, geneetiline testimine, diagnoosimine, Covid-19, viirus