Naučimo o PCR testu jednostavno, baš kao od prijatelja!

Možda se sjećate da smo tijekom pandemije Covid-19 svi pričali o PCR testu . Neki su se vjerojatno malo uplašili, razmišljajući o štapiću umetnutom u nos? Ali što je točno taj PCR test? Može li otkriti samo Covid-19? Ne, PCR je vrlo važna metoda testiranja u medicini koja pomaže u mnogim stvarima. Razgovarajmo o svemu tome danas, jednostavno i jasno, kao da razgovaramo s dobrim prijateljem.

Što je PCR? Možete li to malo objasniti?

Jednostavno rečeno, PCR je kratica za lančanu reakciju polimeraze . Koristi se za otkrivanje genetskog materijala u našem tijelu, bilo DNK ili RNK . Zamislite mali uzorak uzet od vas, to može biti kap krvi ili bris s unutarnje strane vašeg nosa. Taj sićušni komadić DNK ili RNK u tom uzorku se uzima i milijuni, možda milijarde, kopija se izrađuju u laboratoriju. To je ono što znanstvenici nazivaju amplifikacijom , što znači "povećanje" ili "umnožavanje". To je kao da napravite mnogo kopija jednog lista papira fotokopirnim uređajem.

Izradom mnogo ovakvih kopija, znanstvenicima je lakše proučavati DNK ili RNK u izvornom malom uzorku i vidjeti ima li u njemu nešto posebno. PCR pripada skupini testova koji se nazivaju testovi amplifikacije nukleinskih kiselina (NAAT) .

Iako su mnogi čuli riječ PCR u vezi s testiranjem na Covid-19, ova se tehnologija u medicini koristi već dugo i vrlo je korisna metoda.

Što se može otkriti PCR-om?

Sada da vidimo što sve ovaj PCR test može otkriti. Mnogi ljudi misle da je samo za Covid-19. Ali to nije slučaj. Pogledajte:

• Zarazne bolesti: PCR može pomoći u utvrđivanju je li vrućica, prehlada ili kašalj uzrokovan virusom , bakterijom , gljivicom ili parazitom . Na primjer:
• Virus SARS-CoV-2 koji uzrokuje COVID-19 (COVID-19) .
• Gripa , tako obično zovemo gripu.
• Respiratorni sincicijski virus (RSV), koji je posebno čest kod malih beba.
• Bakterije koje uzrokuju tuberkulozu.
• Mnoge druge virusne i bakterijske infekcije.
• Genetske bolesti: Neki ljudi imaju genetske bolesti koje se nasljeđuju, zar ne? Bolesti poput te, na primjer , cistična fibroza.Ovaj PCR se također koristi za dijagnosticiranje stanja poput Huntingtonove bolesti i sindroma fragilnog X. To su vrlo složena stanja, stoga je rano otkrivanje vrlo važno za liječenje.
• Vrste raka: Ova metoda također pomaže u identificiranju određenih vrsta raka, poput limfoma .
• Promjene gena kod raka: Prilikom liječenja osobe s rakom, ovaj PCR test također može otkriti specifične varijacije/mutacije gena u tim stanicama raka. To će omogućiti korištenje ciljane terapije za ciljano djelovanje na te specifične promjene. Ovo je veliki napredak u području liječenja raka.
• Rizik od budućih bolesti: Osobe s određenim genetskim promjenama mogu imati veći rizik od razvoja ozbiljnih bolesti poput raka u budućnosti. Ovaj PCR se također koristi za genetsko testiranje rizika od raka . To vam omogućuje da budete unaprijed svjesni i po potrebi promijenite način života ili da ostanete oprezni redovitim testiranjem.
• Prenatalno testiranje: PCR je također koristan u testovima koji se provode kako bi se utvrdilo ima li nerođeno dijete trudnice genetsku bolest.

Ne samo to, možda ste to vidjeli u filmovima, gdje se uzimaju DNK dokazi, poput sitne dlake ili mrlje krvi pronađene na mjestu zločina, i koriste za identifikaciju kriminalca. Forenzički laboratoriji također koriste ovu PCR tehnologiju za povećanje količine DNK i provođenje testova.

Koji su testovi i metode koji koriste PCR tehnologiju?

PCR tehnologija se koristi u raznim metodama testiranja. Vrsta testa za koji trebate uzeti uzorak ovisit će o tome što testirate. Evo nekoliko primjera:

• Krvne pretrage: Uzima se uzorak krvi i PCR se koristi za otkrivanje genetskih promjena i određenih zaraznih bolesti.
• Bris nazofarinksa: Uzorak sluzi uzet iz unutrašnjosti nosa ili grla može se koristiti za testiranje respiratornih infekcija poput gripe, COVID-19 i RSV-a. To smo svi iskusili tijekom COVID-a.
• Preimplantacijska genetska dijagnoza (PGD) ili preimplantacijski genetski probir (PGS): Tijekom postupka in vitro oplodnje (IVF) , uzima se nekoliko stanica iz embrija i testira se na genetska stanja prije nego što se implantiraju u majčinu maternicu. To se obično radi nekoliko dana nakon uzimanja jajnih stanica.
• Amniocenteza:Tijekom trudnoće, mala količina amnionske tekućine koja okružuje bebu u majčinoj maternici može se koristiti za testiranje genetskog statusa bebe pomoću PCR-a. To je test koji provodi liječnik specijalist.
• Biopsija: Za identifikaciju genetskih mutacija u stanicama raka (molekularno testiranje) uzima se mali uzorak tumora (biopsija tumora) ili biopsija koštane srži. To je poput manjeg kirurškog zahvata. Uzorak se zatim koristi za izvođenje PCR-a kako bi se pronašle genetske promjene.

Kako se pripremate za ovaj test?

U većini slučajeva, PCR test ne zahtijeva posebnu pripremu. Međutim, ovisi o tome što testirate i koja se metoda koristi za uzimanje uzorka. Na primjer, neki testovi krvi mogu zahtijevati da postite nekoliko sati prije. Stoga je najbolje pitati svog liječnika ili ustanovu za testiranje postoji li nešto posebno što trebate učiniti.

Kako PCR funkcionira? Malo znanosti!

Ovo je pomalo znanstvena priča, ali dopustite mi da je objasnim jednostavno. PCR identificira sekvencu koja je jedinstvena za DNK koju želite tražiti, odnosno specifična za nju. Ta sekvenca može biti specifična genetska promjena u raku ili može biti genetski kod virusa ili bakterije. To se naziva ciljna DNK .

Naziv "lančana reakcija polimeraze" odnosi se na proces kojim se u laboratoriju stvara (amplificira) veliki broj kopija ciljne DNA. Ovaj proces koristi enzim koji se zove DNA polimeraza . Ovaj enzim stvara kopije ciljne DNA, ako je prisutna u uzorku.

Ova "lančana reakcija" događa se kada otopina prolazi kroz mnogo ciklusa zagrijavanja i hlađenja. U jednom ciklusu, količina DNK se može udvostručiti. Zamislite to kao jedan do dva, dva do četiri, četiri do osam... i tako dalje, na kraju stvarajući milijune kopija. Prednost ovoga je što PCR može otkriti čak i male količine DNK ili RNK koje bi inače propustili drugi testovi.

Često, nakon što je PCR završen, znanstvenici moraju provesti više testova kako bi analizirali amplificiranu DNK. No ponekad se tijekom PCR procesa u otopinu dodaju posebne oznake koje mogu utvrditi je li uzorak pozitivan ili negativan. Ova se metoda može koristiti za brzo dobivanje rezultata, posebno kada se traže infekcije poput virusa.

Koje vrste PCR-a postoje?

Postoje različite vrste PCR-a. Neke zahtijevaju dodatne korake za kopiranje ili analizu DNK. Pogledajmo dvije glavne vrste:

1. PCR s reverznom transkriptazom (RT-PCR)

Zamislite da genetska informacija koju želimo kopirati i tražiti nije u DNK, već u RNK. (Na primjer, virus Covid-19 ima RNK). Zatim se u ovoj RT-PCR analizi RNK prvo pretvara u DNK pomoću posebnog enzima (reverzne transkriptaze). Nastala DNK naziva se komplementarna DNK (cDNK) . Nakon toga se provodi uobičajeni PCR proces spomenut ranije. Jer se normalna PCR može provesti samo na DNK.

2. PCR u stvarnom vremenu / Kvantitativna PCR (Q-PCR)

U ovom slučaju, kako se izrađuju kopije DNK, dodaju se posebne fluorescentne oznake . Ove oznake emitiraju svjetlost kada se vežu za ciljnu DNK. Zatim, bez dodatnog testiranja, oni koji provode test mogu u stvarnom vremenu vidjeti je li relevantna DNK prisutna u uzorku. Ne samo to, već mogu dobiti i kvantitativnu predodžbu o tome koliko je prisutno.

Zbunjujuće je to što neki ljudi ovo nazivaju i "RT-PCR". Ali to nije isto što i PCR s reverznom transkriptazom spomenut ranije. Također, ova metoda PCR-a u stvarnom vremenu može se koristiti u kombinaciji s PCR-om s reverznom transkriptazom spomenutim ranije. Tada se naziva RT-PCR u stvarnom vremenu (real-time RT-PCR) . Ova metoda RT-PCR-a u stvarnom vremenu koristi se za testove brisa nosa za otkrivanje RNA virusa poput Covid-19 i gripe.

Što nam govore rezultati PCR testa?

Kada dobijete rezultate PCR testa, formulacija se može malo razlikovati, ovisno o tome na što ste testirani.

• Općenito, ako vaš rezultat kaže "otkriveno" ili "prisutno", to znači da imate genetsku mutaciju ili infekciju koju je test tražio.
• Ako rezultat kaže "nije otkriveno", to znači da test nije uspio pronaći ciljanu DNK ili RNK koja se testirala. Međutim, u slučaju infekcije, to ponekad može značiti da ste testirali prerano u procesu infekcije. Možda još uvijek imate infekciju, ali možda u tom trenutku nema dovoljno virusa ili bakterija da bi se otkrili PCR-om.

Kako interpretirati rezultate PCR testa na Covid-19?

Ovo je nešto s čime su mnogi ljudi sada upoznati.

• Pozitivan rezultat PCR-a za COVID - što znači da u vašem izvješću piše "Otkriveno" - znači da ste vjerojatno zaraženi COVID-om-19 ili ste se nedavno oporavili od COVID-a-19 (ponekad PCR može ostati pozitivan neko vrijeme nakon oporavka).
• Ako dobijete negativan ("Nije otkriveno") COVID PCR rezultat, to znači da najvjerojatnije niste imali COVID-19 kada ste uzimali bris nosa. Međutim, kao što sam već spomenuo, ponekad, u ranoj fazi infekcije, posebno ako ste asimptomatski, PCR testovi mogu biti negativni. Dakle, ako imate simptome, vaš liječnik vam može savjetovati da se ponovno testirate za nekoliko dana.

Koliko dugo traje dobivanje PCR rezultata?

To također varira ovisno o provedenom testu.

• Testovi nosnog brisa na uobičajene viruse poput gripe i COVID-19 obično traju nekoliko sati ili dan da bi se dobili rezultati.
• Genetski testovi koji koriste krvne pretrage i metode biopsije mogu potrajati tjedan dana ili više da bi se dobili rezultati jer je proces analize malo složeniji.

Kada trebate posjetiti liječnika?

Ako imate bilo kakvih pitanja ili nedoumica u vezi s PCR testom ili njegovim rezultatima, svakako razgovarajte sa svojim liječnikom. On vam može sve objasniti.

Najvažnija poruka koju treba ponijeti kući

Iako su riječi "PCR test" iznenada ušle u naše svakodnevne razgovore s pandemijom COVID-19 2020. godine, to je zapravo vrlo vrijedna tehnologija koju liječnici koriste desetljećima. PCR pomaže u identificiranju i kopiranju sićušnih količina DNK ili RNK, što se može koristiti za dijagnosticiranje raznih zdravstvenih stanja.

Iako je ovo uobičajeno za liječnike, možda nije uobičajeno da se vi podvrgnete testu. Razumijemo to. Ali najbolje je što je potreban samo mali uzorak vašeg tijela, a postupak obično traje samo nekoliko minuta. Ako imate bilo kakvih pitanja, nedoumica ili nedoumica u vezi s ovim, obratite se svom liječniku. Objasnit će vam sve. Ostanite zdravi!

PCR test, DNK, RNK, genetsko testiranje, dijagnoza, Covid-19, virus