Kaj je PCR test? Pogovorimo se o tem preprosto!

Ko slišimo besedo PCR, pomislimo na pandemijo covida, kajne? Čas, ko smo si morali vtakniti bris v nos in čakati na izvid ... tega ne bomo nikoli pozabili. Ste pa vedeli, da se PCR ne uporablja samo za odkrivanje covida? To je pravzaprav zelo pomemben test, ki je naredil velik preboj v medicinski znanosti. Zato se danes pogovorimo o tem, kaj je ta test PCR, kaj še lahko zazna in kako deluje na preprost način, ki ga lahko razumete.

Kaj je preprosto PCR?

Prav, recimo takole. Predstavljajte si, da bi morali najti eno samo besedo na eni strani ene same knjige, med tisoči knjig v veliki knjižnici. Kako težko bi to bilo? To je kot najti droben delček DNK ali RNK , genskega materiala v celicah v našem telesu.

Tehnologija PCR (verižna reakcija s polimerazo) olajša to težko nalogo. S tem se najmanjši delček DNK ali RNK, ki ga iščemo, kopira stotisoče, celo milijonkrat (amplifikacija). To je kot če bi v knjižnični knjigi našli stran z besedo, jo vstavili v fotokopirni stroj in naredili približno milijon kopij. Ker je ta težko najdljiva beseda zdaj povsod, jo lahko zlahka prepoznamo.

Preprosto povedano, PCR je test, pri katerem se iz našega telesa odvzame zelo majhna količina celice, kapljica krvi ali bris nosu, in v laboratoriju umetno vzgoji specifičen delček DNK ali RNK, da se potrdi, ali je prisoten v našem vzorcu ali ne. To je zelo občutljiv test. To pomeni, da lahko zazna celo zelo majhne količine virusa. Ta metoda spada v skupino testov, imenovanih test amplifikacije nukleinskih kislin (NAAT).

Katere bolezni je mogoče odkriti s PCR testom?

Čeprav je PCR postal priljubljen zaradi pandemije COVID-19, se v medicini uporablja že desetletja. S tem testom je mogoče odkriti veliko stvari. Oglejmo si nekaj glavnih.

Kako vzamete vzorec za PCR test?

Način odvzema vzorca za PCR test je odvisen od vrste bolezni, ki jo iščete. Metoda odvzema vzorca se razlikuje za vsako bolezen.

Večinoma se vam za pripravo na PCR test ni treba posebej pripraviti. Vendar pa vam bo zdravnik v nekaterih primerih, na primer pri biopsiji, predhodno dal potrebna navodila.

Kako deluje PCR tehnologija?

V redu, zdaj pa poglejmo, kako ta neverjetna tehnologija dejansko deluje. To je nekoliko znanstveno, vendar bom razložil preprosto.

1. Priprava vzorca: Najprej se iz vzorca (kri, izločki itd.), ki vam je bil odvzet, izolira DNK ali RNK.

2. Priprava mešanice: Nato se ta izolirana DNK/RNA zmeša z nekaj posebnimi kemikalijami. Glavna stvar v tej mešanici je encim, imenovan DNK polimeraza . To je glavna snov, ki opravlja delo fotokopiranje.

3. Cikel segrevanja in hlajenja: Majhna cev s to mešanico se sedaj namesti v posebno napravo. Ta naprava zelo hitro zviša in zniža temperaturo.

• Denaturacija: Najprej se temperatura zviša na približno 95 stopinj Celzija. To povzroči ločitev obeh verig DNK.
• Žarjenje: Nato se temperatura zniža na približno 14 stopinj Celzija. Nato se na ločene verige DNK pritrdijo majhni koščki DNK (primerji), ki se ujemajo z iskanim fragmentom DNK.
• Ponovno segrevanje (raztezanje): Nato se temperatura dvigne na približno 22 stopinj Celzija. Nato pride v poštev encim DNA polimeraza in iz tega primerja ustvari novo verigo DNA, ki se ujema z originalno verigo DNA.

4. Kopiranje: Sedaj sta bili narejeni dve kopiji ene verige DNK. Ta temperaturni cikel se ponovi približno 30–40-krat. V enem ciklu se količina DNK podvoji. Dve postanejo štiri, štiri postanejo osem, osem postane šestnajst ... Po približno 30 ciklih je bilo iz enega samega originalnega koščka DNK narejenih več kot milijarda kopij.

Zdaj je ta fragment DNK/RNA, ki je bil prej premajhen za zaznavanje, postal dovolj velik, da ga je mogoče zlahka zaznati.

Ali obstajajo vrste PCR testov?

Da, obstajata predvsem dve vrsti, ki se ju moramo zavedati.

• PCR z reverzno transkriptazo (RT-PCR): Nekateri virusi, kot so Covid, gripa in HIV, imajo svoje genetske informacije v RNK in ne v DNK. Običajna PCR lahko kopira samo DNK. Pri RT-PCR torej najprej uporabite poseben encim ("reverzna transkriptaza"), da "pretvorite" to RNK v DNK. Nastala DNK se imenuje komplementarna DNK (cDNK). Nato sledi običajni postopek PCR.

• PCR v realnem času / kvantitativna PCR (Q-PCR): To je nekoliko naprednejša metoda. Pri njej se med kopiranjem DNK nanjo pritrdi fluorescentna oznaka. Ko se količina kopirane DNK poveča, se poveča tudi ta fluorescenca. Naprava lahko izmeri to fluorescenco. Medtem ko čakamo, torej v realnem času , lahko vidimo, ali je ustrezna DNK prisotna v vzorcu ali ne. Poleg tega lahko da tudi grobo predstavo o tem, koliko virusa je bilo v prvotnem vzorcu (virusna obremenitev). Za odkrivanje Covida se pogosto uporablja test RT-PCR v realnem času , ki združuje obe metodi.

Kaj pomeni PCR poročilo?

Zelo pomembno je, da razumete poročilo PCR, ko ga prejmete.

• Zaznano / Pozitivno: Če v vašem poročilu piše »Zaznano« ali »Pozitivno«, to pomeni, da je vaš vzorec vseboval dele virusa ali genskega materiala, ki so ga iskali. Preprosto povedano, verjetno ste okuženi.

• Ni zaznano / Negativno: To pomeni, da v testiranem vzorcu ni bilo mogoče najti ustreznih fragmentov DNK/RNK. To pomeni, da najverjetneje nimate te okužbe.

Čas, potreben za pridobitev rezultatov, je odvisen od opravljenega testa. Brisi nosu (kot so COVID, gripa) običajno dobijo rezultate v 24 urah. Vendar pa lahko krvne preiskave in biopsije za iskanje genetskih bolezni trajajo teden dni ali več.

Če imate kakršna koli vprašanja ali pomisleke glede testa PCR ali njegovih rezultatov, se o tem posvetujte s svojim zdravnikom.