X'inhu test PCR? Ejja nitkellmu dwaru b'mod sempliċi!

Meta nisimgħu l-kelma PCR, naħsbu fil-pandemija tal-Covid, hux? Iż-żmien meta kellna npoġġu swab f'imnieħerna u nistennew ir-rapport... dan qatt mhu se jintesa. Imma kont taf li l-PCR mhux biss jintuża biex jinstab il-Covid? Dan huwa fil-fatt test importanti ħafna li għamel avvanz kbir fix-xjenza medika. Allura llum, ejja nitkellmu dwar x'inhu dan it-test tal-PCR, x'affarijiet oħra jista' jiskopri, u kif jaħdem b'mod sempliċi li tista' tifhem.

X'inhu PCR sempliċement?

Tajjeb, ejja ngħiduha hekk. Immaġina li kellek issib kelma waħda fuq paġna waħda ta’ ktieb wieħed, minn eluf ta’ kotba f’librerija kbira. Kemm ikun diffiċli dan? Huwa bħal li ssib biċċa ċkejkna ta’ DNA jew RNA , il-materjal ġenetiku ġewwa ċ-ċelloli f’ġisimna.

It-teknoloġija PCR (Polymerase Chain Reaction) tagħmel dan il-kompitu diffiċli aktar faċli. Dak li tagħmel din hija li tikkopja l-iżgħar biċċa DNA jew RNA li nkunu qed infittxu mijiet ta’ eluf, anke miljuni ta’ drabi (amplifikazzjoni). Huwa bħal li ssib il-paġna bil-kelma fil-ktieb tal-librerija, tpoġġiha f’magna tal-fotokopji, u tagħmel madwar miljun kopja. Imbagħad, peress li dik il-kelma diffiċli biex issibha issa tinsab kullimkien, nistgħu nidentifikawha faċilment.

Fi kliem sempliċi, il-PCR huwa test li jieħu ammont żgħir ħafna ta’ ċellula minn ġisimna, qatra demm, jew kampjun nażali, u jkabbar artifiċjalment biċċa speċifika ta’ DNA jew RNA fiha f’laboratorju biex jikkonferma jekk hijiex preżenti fil-kampjun tagħna jew le. Dan huwa test sensittiv ħafna. Dan ifisser li jista’ jiskopri anke ammonti żgħar ħafna tal-virus. Dan il-metodu jappartjeni għal grupp ta’ testijiet imsejħa Test tal-Amplifikazzjoni tal-Aċidu Nuklejku (NAAT).

Liema mard jista' jiġi skopert permezz ta' testijiet tal-PCR?

Għalkemm il-PCR sar popolari minħabba l-pandemija tal-COVID, ilu jintuża fid-dinja medika għal għexieren ta' snin. Hemm ħafna affarijiet li jistgħu jiġu skoperti b'dan it-test. Ejja nagħtu ħarsa lejn uħud mill-aktar importanti.

Kif tieħu kampjun għal test PCR?

Il-mod kif tieħu kampjun għal test PCR jiddependi mit-tip ta’ marda li qed tfittex. Il-metodu ta’ kif tieħu kampjun huwa differenti għal kull kundizzjoni.

Ħafna drabi, m'għandekx bżonn tagħmel xi ħaġa speċjali biex tipprepara għal test PCR. Madankollu, f'xi każijiet, bħal meta tagħmel xi ħaġa bħal bijopsija, it-tabib tiegħek jagħtik l-istruzzjonijiet meħtieġa minn qabel.

Kif taħdem it-teknoloġija tal-PCR?

Tajjeb, issa ejja naraw kif taħdem din it-teknoloġija tal-għaġeb fil-fatt. Dan huwa daqsxejn xjentifiku, imma se nispjegah b'mod sempliċi.

1. Tħejjija tal-kampjun: L-ewwel, id-DNA jew l-RNA jiġi iżolat mill-kampjun (demm, sekrezzjonijiet, eċċ.) meħud minnek.

2. Kif tagħmel it-taħlita: Imbagħad, dan id-DNA/RNA iżolat jitħallat ma’ xi kimiċi speċjali. Il-ħaġa prinċipali f’din it-taħlita hija enzima msejħa DNA Polymerase . Din hija l-enzima prinċipali li tagħmel ix-xogħol ta’ fotokopjar.

3. Ċiklu ta' Tisħin u Tkessiħ: Issa t-tubu żgħir b'din it-taħlita jitqiegħed f'magna speċjali. Din il-magna tgħolli u tbaxxi t-temperatura malajr ħafna.

• Denaturazzjoni: L-ewwel, it-temperatura tiżdied għal madwar 95 grad Celsius. Dan iwassal biex iż-żewġ linji tad-DNA jisseparaw.
• Annealing: Imbagħad, it-temperatura titbaxxa għal madwar 55 grad. Imbagħad, biċċiet żgħar ta' DNA (primers) li jaqblu mal-framment tad-DNA li qed infittxu jitwaħħlu mal-linji separati tad-DNA.
• Tisħin mill-ġdid (Estensjoni): Imbagħad it-temperatura titla’ għal madwar 72 grad. Imbagħad tidħol l-enzima tad-DNA polymerase u tagħmel linja ġdida tad-DNA minn dak il-primer li taqbel mal-linja oriġinali tad-DNA.

4. Ikkupjar: Issa saru żewġ kopji ta’ linja waħda tad-DNA. Dan iċ-ċiklu tat-temperatura jirrepeti ruħu madwar 30-40 darba. F’ċiklu wieħed, l-ammont ta’ DNA jirdoppja. Tnejn isiru erbgħa, erbgħa jsiru tmienja, tmienja jsiru sittax... Wara madwar 30 ċiklu, saru aktar minn biljun kopja mill-biċċa waħda oriġinali tad-DNA.

Issa, dak il-framment tad-DNA/RNA, li qabel kien żgħir wisq biex jiġi skopert, sar kbir biżżejjed biex jiġi skopert faċilment.

Hemm tipi ta’ testijiet tal-PCR?

Iva, hemm prinċipalment żewġ tipi li rridu nkunu konxji tagħhom.

• PCR b'reverse-transcriptase (RT-PCR): Xi viruses, bħal Covid, influwenza, u HIV, għandhom l-informazzjoni ġenetika tagħhom fl-RNA aktar milli fid-DNA. Il-PCR normali jista' jikkopja biss id-DNA. Għalhekk, dak li tagħmel fl-RT-PCR huwa li l-ewwel tuża enzima speċjali ("Reverse Transcriptase") biex "tikkonverti" dak l-RNA f'DNA. Id-DNA li tirriżulta tissejjaħ DNA komplementari (cDNA). Imbagħad iseħħ il-proċess normali tal-PCR.

• PCR f'ħin reali / PCR kwantitattiv (Q-PCR): Dan huwa metodu kemxejn aktar avvanzat. Dak li jiġri f'dan huwa li hekk kif id-DNA jiġi kkupjat, titwaħħal tikketta fluworexxenti miegħu. Hekk kif l-ammont ta' DNA kkupjat jiżdied, din il-fluworexxenza tiżdied ukoll. Il-magna tista' tkejjel din il-fluworexxenza. Għalhekk, waqt li nkunu qed nistennew, jiġifieri, f'ħin reali , nistgħu naraw jekk id-DNA rilevanti huwiex preżenti fil-kampjun jew le. Mhux hekk biss, iżda jista' wkoll jagħti idea ġenerali ta' kemm kien hemm virus fil-kampjun oriġinali (tagħbija virali). Test RT-PCR f'ħin reali li jikkombina dawn iż-żewġ metodi spiss jintuża biex jinstab il-Covid.

Xi tfisser ir-rapport tal-PCR?

Huwa importanti ħafna li tifhem rapport tal-PCR meta tirċevih.

• Misjuba / Pożittiva: Jekk ir-rapport tiegħek jgħid "Mikxufa" jew "Pożittiva," ifisser li l-kampjun tiegħek kien fih partijiet mill-virus jew materjal ġenetiku li kienu qed ifittxu. Fi kliem sempliċi, probabbilment għandek l-infezzjoni.

• Mhux Misjuba / Negattiva: Dan ifisser li l-frammenti tad-DNA/RNA rilevanti ma setgħux jinstabu fil-kampjun ittestjat. Dan ifisser li x'aktarx m'għandekx dik l-infezzjoni.

Kemm iddum biex jinkisbu r-riżultati jvarja skont it-test li jkun qed isir. It-testi tat-test nażali (bħal dawk tal-COVID, l-influwenza) ġeneralment jagħtu riżultati fi żmien 24 siegħa. Madankollu, it-testijiet tad-demm u l-bijopsiji biex jinstabu mard ġenetiku jistgħu jieħdu ġimgħa jew aktar.

Jekk għandek xi mistoqsijiet jew tħassib dwar test PCR jew ir-riżultati tiegħu, kun żgur li tkellem mat-tabib tiegħek dwar dan.